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新一代测序(NGS)的发现和应用
2019-4-15 19:01
新一代测序 高通量测序RNA-seq RNA-seq 新一代测序技术(NGS)可以生成高通量RNA-seq数据,深入研究转录组,包括454, illumina, SOLiD and Ion Torrent技术,以及先进的单分子long-reads测序方法,包括PacBio and nano-pore sequencing(纳米孔测序)。高通量测序的易用性使得长非编码(IncRNA)的识别成为可能 ...
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RPKM和FPKM值衡量基因表达量
2019-3-27 18:29
衡量基因表达量的 RPKM 和 FPKM 两种方法 RPKM ( Reads Per Kilobase per Million)和 F PKM ( Fragments Per Kilobase per Million) 同一个样本中基因A和基因B的相对表达量,或者不同样本中,同一个基因的相对表达量。 引入“每一千碱基(per kilobase)”的原因在于,不同的RNA可能有不同长度, ...
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[转载]转录组测序设计
2019-3-26 12:01
转录组测序设计与数据分析 鹰嘴豆种子大小和重量的转录组测序的实验方法学习 转录组定义 转录组 是一个或一群细胞中所有RNA分子的集合。指所有RNA(或仅指mRNA),具体取决于具体的实验。包括每个RNA分子的量或浓度。 转录组可以视为蛋白质组(即基因组表达的整组蛋白质)的子集。mRNA的水平与它们编码 ...
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[转载]外显子/内含子/mRNA/CDS/ORF的区别与联系
2019-3-23 12:15
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[转载]20个转录组知识点
2019-1-4 12:30
Question and Answer 1、什么是转录组测序? 转录组广义上指在某一生理条件下,细胞内所有转录组产物的集合,包括:mRNA、ncRNA、rRNA等;狭义上指所有mRNA的集合。 转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,主要包括mRNA和ncRNA。 转录组具有时间特异 ...
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[转载]拟南芥盐胁迫适应性的关键蛋白——AtHKT1;1, 植物光形态建成新机制
2019-1-4 12:26
拟南芥盐胁迫适应性的关键蛋白—— AtHKT1;1 在世界范围内有超过 3 亿公顷的陆地中的土壤盐分(主要为 NaCl )过高,达到了全球陆地面积的 6% 左右。研究人员收集了西班牙东北沿海多个不同盐含量区域的 77 个生态型的拟南芥,通过重测序并和已有的 1135 份来自世界各地的拟南芥生态型进行了遗传学、生理学和生态学分 ...
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GMT+8, 2024-4-26 02:54

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