daishoujun的个人博客分享 http://blog.sciencenet.cn/u/daishoujun

博文

Materials Studio构建的模型如何导入lammps

已有 9847 次阅读 2018-4-19 16:43 |个人分类:lammps|系统分类:科研笔记| lammps, VASP, ubuntu

 参考原文:1.http://www.52souji.net/how-to-import-the-model-built-using-ms-into-lammps.html

                     2.http://www.52souji.net/vasp-poscar2lammps-format-convert.html

                     3.https://sites.google.com/site/pmitev/academic/vasp-poscar2lammps-awk

需要注意的是:

Dependencies.

  The script needs gawk in order to run. It expects that that awk is located under /bin. If this is different in your Linux distribution, just change the first line accordingly.

脚本需要gawk,需要安装此软件,指令如下:

sudo apt-get install gawk

 之后将VASP-poscar2lammps.awk和获得vasp格式文件放到同一文件夹下,因为awk文件在/usr/bin文件下,(我也不知道怎么到这里了),需要将VASP-poscar2lammps.awk,第一行进行修改:

Screenshot from 2018-04-10 20-53-25.png

修改如下:

Screenshot from 2018-04-10 20-53-25.png

在终端输入: VASP-poscar2lammps.awk Cu2.vasp>data.lammps2

root@daishoujun-Virtual-Machine:/usr/bin# VASP-poscar2lammps.awk Cu2.vasp>data.lammps2
下行是对上行的解释,

VASP-poscar2lammps.awk f.POSCAR > f.lammps

其中,VASP-poscar2lammps.awk为转换脚本名称,f.POSCAR为具有VASP POSCAR结构的文件的文件名,f.lammps为转换的LAMMPS结构文件的文件名。

其它:把脚本VASP-poscar2lammps.awk下载下来,拷贝到你的当前目录(或者添加到系统路径中),修改权限为可执行(chmod +x),+前面有个空格。



https://blog.sciencenet.cn/blog-3384943-1109807.html

上一篇:ovito linux系统下路径问题
下一篇:【LAMMPS如何系列】计算热膨胀系数
收藏 IP: 114.242.248.*| 热度|

0

该博文允许注册用户评论 请点击登录 评论 (0 个评论)

数据加载中...

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2024-4-25 14:40

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部