1.【Nature】玉米中表达失调与稀有等位基因负荷和适应性损失相关

255个品系的七种组织的转录组。我们定位表达数量性状基因位点，并鉴定了罕见遗传变异对基因表达极端情况的贡献的特征。玉米基因组中出现的一些新突变可能是有害的;虽然选择的作用是让有害的变异体变得罕见，但完全去除它们受到与有利基因位点连锁、种群大小有限的阻碍。现代玉米育种家已通过人工选择和自交系统地减少了这种持续突变压力的影响，这些变异暴露了优良自交系中罕见的隐性变异。然而，这些稀有等位基因对现代近交玉米的持续影响尚不清楚。通过分析这个基因表达资源，并利用玉米的极端多样性和快速连锁不平衡衰退，我们描述了稀有等位基因和进化历史对表达调控的影响。罕见的等位基因与表达调节异常相关，我们将这种调节异常关联到种子重量适应性。我们发现在现代自交系中定位到的表达数量性状基因位点中富含祖先稀有变，这表明历史瓶颈已经形成了调节。我们的研究结果表明农业物种进一步遗传改良的一条途径在于清除与作物健康相关的罕见有害变异。

Kremling K A G, Chen S Y, Su M H, et al. Dysregulation of expression correlates with rare-allele burden and fitness loss in maize[J]. Nature, 2018.

2.【Cell】黄素单加氧酶生成的N-羟基哌啶酸是植物系统免疫的关键元素

在微生物接种之后，植物可以诱导对病原体感染的广谱免疫，这是一种被称为系统获得性抗性（SAR）的现象。在拟南芥中SAR的建立受Lys分解代谢物哌可酸（Pip）和黄素依赖性单加氧酶1（FMO1）调控。在这里，我们显示升高Pip足以诱导依赖FMO-1的叶片转录组重组，可帮助植物获得SAR。在植物体内和体外实验中显示，FMO1作为一个甲基哌啶N-羟化酶发挥作用，催化Pip向N-羟基哌啶酸（NHP）的化学转化。 当植物被微生物侵染后，NHP会在植物体内累积。当外源施用时，它可以恢复NHP-缺陷突变体fmo1获得抗性的表型，并可作为植物对细菌和卵菌感染产生免疫力的有效诱导剂。我们已经在植物中鉴定出一种病原菌诱导的L-Lys分解代谢途径，其产生N-羟基化的氨基酸NHP作为可作为植物获取对于病原菌侵染的系统获得性抗性的重要调控因子。

Hartmann M, Zeier T, Bernsdorff F, et al. Flavin Monooxygenase-Generated N-Hydroxypipecolic Acid Is a Critical Element of Plant Systemic Immunity[J]. Cell, 2018.

3.【New Phytologist】地钱植物Marchantia polymorpha的遗传分析揭示R2R3MYB激活类黄酮产生以响应非生物胁迫是陆地植物中的古老特征

5.【Plant physiology】多组学协助檀香基因组的组装和注释

6.【Plant physiology】挪威云杉木材形成季节变化的转录线路图

7.【Molucular Cell】损伤激活茉莉酸生物合成相关JAV1-JAZ8-WRKY51复合物的依赖Ca2 + /钙调素的磷酸化

8.【Journal of Experimental Botany】通过巢式关联作图揭示生长在两个欧洲环境下的野生大麦显著差异的遗传调控