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软件学习| 技术交流|

置顶 · 用AutoDock进行分子对接教程——半柔性对接: 热度 2 2017-12-20 20:58; 以下所有内容均属于个人学习过程中的总结，如有错误，欢迎批评指正！ Autodock 分子对接教程 First release：2017-12-20 Last update: 2018-07-24 Autodock 是一款分子对接软件包，开源且免费，官方网址是 http://autodock.scripps.edu/ ，目前最新的版本是 AutoDock 4.2.6 ，包括 ...; 个人分类: 软件学习|35908 次阅读|5 个评论热度 2

Linux中快速创建大量文件夹的命令: 杜文义 2018-8-7 15:38; 以下所有内容均属于个人学习过程中的总结，如有错误，欢迎批评指正！ Linux下快速创建大量文件夹的命令 First release：2018-08-07 Last update: 2018-08-014 在linux使用过程中有时会需要创建大量的文件夹，创建文件夹的命令是mkdir 内容如下，直接在shell ...; 个人分类: 技术交流|3416 次阅读|没有评论

AMBER中mdout_analyzer.py和ambpdb的使用: 杜文义 2018-7-22 16:17; 以下所有内容均属于个人学习过程中的总结，如有错误，欢迎批评指正！ AMBER中 mdout_analyzer.py 和 ambpdb 的使用 First release：2018-07-22 Last update: 2018-07-22 本文内容基于Amber最新版本Amber18 mdout_analyzer.py 是快速分析sander和pmemd计算得到的out文 ...; 个人分类: 技术交流|5998 次阅读|没有评论

Amber和Gaussian联用计算RESP原子电荷: 杜文义 2018-3-17 20:06; 以下所有内容均属于个人学习过程中的总结，如有错误，欢迎批评指正！ Amber和Gaussian联用计算RESP原子电荷 First release：2018-03-17 Last update: 2018-07-22 原子电荷，顾名思义就是位于原子中心点的电荷，是对体系中电荷分布最为简单的描述。原子电荷可以帮助化学研究者们考察 ...; 个人分类: 技术交流|7094 次阅读|没有评论

用Amber进行能量分解和计算结合自由能——MMPBSA工具: 杜文义 2018-1-13 11:15; 以下所有内容均属于个人学习过程中的总结，如有错误，欢迎批评指正！用Amber进行能量分解和计算结合自由能 First release：2018-01-13 Last update: 2018-03-17 Amber是一款适用于生物大分子的动力学模拟的软件，其官方网站是 http://ambermd.org/index.html ，目前最新版本为Amber17 ...; 个人分类: 技术交流|13218 次阅读|没有评论

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