博文
- 一作解读Microbiome：所谓的“富集培养”获得的微生物真的都是被“富集”出来的吗？
- Microbiome杂志2018年12月26日在线发表山东大学海洋学院杜宗军组关于“未培养微生物可培养机制”的文章，在此向杜宗军团队表示祝贺，同时很高兴邀请到第一作者穆大帅副教授亲自为大家带来最原汁原味的解读。 Microbiome：所谓的“富集培养”获得的微生物真的都是被“富集”出来的吗？ 第一作者：穆大帅 通讯作者 ...
- QIIME 2用户文档. 5粪菌移植分析练习Fecal microbiota transplant (FMT) stud
- 前情提要 文章导读：QIIME 2可重复、交互和扩展的微生物组数据分析流程 1简介和安装 2插件工作流程概述 3老司机上路指南 4人体各部位微生物组分析 QIIME 2用户文档. 5粪菌移植分析练习 Fecal microbiota transplant (FMT) study: an exercise https://docs.qiime2.org/2018.11/tutorials/fmt/ ...
- QIIME 2用户文档. 4人体各部位微生物组分析实战Moving Pictures(2018.11)
- 前情提要 文章导读：QIIME 2可重复、交互和扩展的微生物组数据分析流程 1简介和安装 2插件工作流程概述 3老司机上路指南 QIIME 2用户文档. 4人体各部位微生物组 “Moving Pictures” tutorial https://docs.qiime2.org/2018.11/tutorials/moving-pictures/ 注意：本文学习需要安装好QIIME 2，请务 ...
- QIIME 2用户文档. 3老司机上路指南(2018.11)
- 前情提要 文章导读：QIIME 2可重复、交互和扩展的微生物组数据分析流程 1简介和安装 2插件工作流程概述 老司机上路指南 QIIME 2 for Experienced Microbiome Researchers 本节5365字，我们将介绍如何使用QIIME 2处理微生物数据。本节教程主要针对经验丰富的微生物研究人员，即已经对如何处理数据非常 ...
- Gut, IJC等4篇文章聚焦——吃太多红肉对身体真的不好，直指心血管疾病、乳腺癌、憩室炎……
- 吃太多红肉对身体真的不好，直指心血管疾病、乳腺癌、憩室炎…… 年末岁初，各种聚会成为了每天的日常安排，Lily爸妈在最近一周就参加了五场party。作为无肉不欢的典型食肉动物，每次聚餐各种肉食自然是席间首选，其中，红肉是绝对的重头戏——所谓的红肉，就是指加工之前呈现红色的肉类，像是猪牛羊肉，而禽类则统称 ...
- QIIME 2：可重复、交互和扩展的微生物组数据分析流程
- 2010年发表于Nature Methods的QIIME 是微生物组领域最广泛使用的扩增子数据分析流程，截止2018年12月16日，Google Scholar统计引用 13,126 次。随着近年来测序通量的提高，大规模研究开展，其软件架构己法满足当前微生物组可重复分析的要求。 为满足当前大数据、可重复分析的需求，由QIIME第一作者Gregory Caporaso领 ...
- QIIME 2用户文档. 1简介和安装(2018.11)
- 写在前面 QIIME是微生物组领域最广泛使用的分析流程，8年引超1.3万次。为满足当前大数据、可重复分析的需求，Gregory Caporaso教授于2016年从头开发了QIIME 2，并获得了来自全世界70多家单位的100多名同行参与，于2018年全面接档QIIME。 宏基因组团队于2017年6月加入了项目的测试和教程编写，并负责中文文档的翻译和 ...
- 再这么配培养基，你的细菌都被毒死了！
- 本文“宏基因组”公众号原创。 作者：猴头菇5518 编辑：metagenome 微生物培养基的前世 微生物学家使用琼脂培养基已有120多年的历史。在1880年，著名的微生物学家科赫（提出病原微生物科赫氏法则）发明了微生物学领域这一革命性技术: 用固体培养基进行的细菌纯培养 。这种方法解决了用液体培养基培养细菌时，各种 ...
- 亦正亦邪，骨骼惊奇的LGG
- 亦正亦邪，骨骼惊奇的LGG LGG，这既不是你家雪地靴UGG的山寨品牌，也不是“老公公”的简称，今天我们来聊的是一款颇负盛名的 益生菌——鼠李糖乳杆菌GG（Lactobacillus rhamnosus GG），简称为LGG 。 Lactobacillus rhamnosus GG 图片来源： https://alchetron.com/Lactobacillus-rhamnosus 这个益生菌是从健康 ...
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