woodcorpse的个人博客分享 http://blog.sciencenet.cn/u/woodcorpse

博文

按标题搜索
分享 Nature Methods:快速准确的微生物来源追溯工具FEAST
2019-6-25 21:38
FEAST: 快速准确的微生物来源追溯工具 FEAST: 快速期望最大化的微生物来源追溯 FEAST: fast expectation-maximization for microbial source tracking Nature Methods 2019-06-10 Articles DOI: https://doi.org/10.1038/s41592-019-0431-x 第一作者:Liat Shenhav 1 通讯作者:Eran ...
个人分类: R|147 次阅读|没有评论
分享 Microbiome:城市海滩和污水中抗生素抗性组研究
2019-6-25 21:34
城市海滩和污水中抗生素抗性组研究 宏基因组学揭示城市海滩和污水中的抗生素抗性库 Urban metagenomics uncover antibiotic resistance reservoirs in coastal beach and sewage waters Microbiome, 2019-02-28 Articles DOI: https://doi.org/10.1186/s40168-019-0648-z 第一作者:Pablo Fresia ...
个人分类: 读文献|93 次阅读|没有评论
分享 Gut:北京生科院赵方庆团队揭示人体口腔菌群的稳定性和动态变化规律
2019-6-25 17:15
人体口腔菌群的稳定性和动态变化规律 追踪体内人类口腔微生物组的积累,阐明了胃肠道入口的微生物群落动态变化 Tracing the accumulation of in vivo human oral microbiota elucidates microbial community dynamics at the gateway to the GI tract Gut 2019-06-20 Letter DOI: https: ...
个人分类: 读文献|172 次阅读|没有评论
分享 [转载]linux统计分析命令datamash
2019-6-24 21:14
本文转载自“生信菜鸟团” 引子 之前写 awk 教程的时候,曾经提到过一些对文本中行列进行某些计算统计的需求,例如使用数组分类求和。一些基本需求 awk 都可以实现,但是写起来稍显复杂。在 R 中使用 dplyr 或者基础函数 aggregate() 可以方便的进行分组操作,如果能在 linux 中使用更加简洁的单行命令针对数值和字 ...
个人分类: Linux|155 次阅读|没有评论
分享 宏基因组 微生物组 微生态杂志简介及2019最新影响因子
2019-6-21 08:36
2019年6月20日,2018年度的影响因子发布了,各种影响因子汇总的文章瞬间刷爆了朋友圈。 作为本领域的专业公众号,每年都会借此机会系统介绍一下本领域的杂志,为同行文献阅读选择、文章投稿杂志选择、毕业升职加薪助力。 祝大家2019都能实现自己的一个小目标,集齐CNS! 后台回复 影响因子 ,获得2019最新完整版影响因 ...
个人分类: 经验|220 次阅读|没有评论
分享 Nat. Med. :婴儿生命早期肠道病毒组和细菌组的动态
2019-6-18 15:20
婴儿生命早期肠道病毒组和细菌微生物组的动态 Early life dynamics of the human gut virome and bacterial microbiome in infants 翻译:秋芒树 英国帝国理工学院 责编:刘永鑫 中科院遗传发育所 原文链接: https://www.nature.com/articles/nm.3950 Nature Medine DOI: 10.1038/nm.3950 作者:Efrem ...
个人分类: 读文献|333 次阅读|没有评论
分享 R语言大会:宏基因组数据分析和可视化套路总结
2019-6-16 17:31
2019年5月25日,我应邀参加在人民大学召开的R语言大会。 《5月24-26日,第12届中国R会议(北京)可视化专场》 作题为《R语言在宏基因组数据统计分析及可视化中的应用》。虽然报告时间是早点8点半,但现场坐无虚席,后面过道都站满了人。现在80多位朋友也通过面对面建群的方式获得了课件。 后来有朋友联系我索要报 ...
个人分类: R|210 次阅读|没有评论
分享 ggThemeAssist:鼠标调整ggplot2主题,不用再记这些代码啦!
2019-6-15 19:01
ggThemeAssist:鼠标调整主题,并返回代码 R语言中的ggplot2是最美的绘图包之一。但调整主题的细节,需要写大量代码,而且反复修改、预览,费时费力。 当然你可以用Adobe Illustrator等工具进行后期编辑,但要是图重画,所有后期编辑的工作又要重来,无法实现可重复分析,每个修改都很崩溃。 有没有更方便的方式调整主 ...
个人分类: R|322 次阅读|没有评论
分享 R语言一键批量完成差异统计和可视化
2019-6-10 23:24
撰文:文涛 南京农大 责编:刘永鑫 中科院遗传发育所 R语言一键完成差异检测从数据到展示 单因素 差异 分析的完整方案 关键词:正态性检验;方差齐性;非参数检验;秩和检验;多重比较;带显著性字母柱状图或箱线图 由于作者水平有限,大家可以添加我的个人微信讨论细节、bug和可改进的地方(微信号:nanjingxuez ...
个人分类: 宏基因组|348 次阅读|没有评论
分享 淡水:21世纪的分子微生物生态学
2019-6-9 13:13
撰文:黄朝 西北大学 责编:刘永鑫 中科院遗传发育所 淡水:21世纪的分子微生物生态学 摘要 微生物无处不在,是具有生态意义的淡水环境分类和功能多样化的组成部分。淡水系统中的细菌,古细菌和真核微生物支持一系列生态过程和功能。然而,我们对微生物生态学知之甚少。随着人类新世纪的发展,对淡水的需 ...
个人分类: 读文献|215 次阅读|没有评论

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备14006957 )

GMT+8, 2019-6-27 14:22

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部