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用ggvegan包进行db-RDA微生物环境因子分析
刘永鑫 2018-3-19 20:39
本文“宏基因组”公众号原创。 作者:舟行天下 编辑:metagenome 前言 在进行微生物多样性分析时,大家一定会做α,β多样性分析。α多样品通俗来讲就是样本内的物种多样性。β多样性是指在地区尺度上,物种组成沿着某个梯度方向从一个群落到另一个群落的变化率。即沿着某一环境梯度,物种替代的速率、物种周转率等。 ...
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R画月亮阴晴圆缺:corrplot绘图相关系数矩阵
刘永鑫 2018-3-1 22:09
今天是十五元宵节,即是和家人团聚的机会,也是赏月的好日子。 但作为科研汪的我,在狗年应更加努力,争取在狗年旺旺,从加班狗中脱颖而出。 分享一个相关分析可视化实战,祝大家元宵节快乐! 先给大家送一个我画的假蓝月亮,不管你看着像不像,反正我觉得像。 之前我们分享了关于相关分析的原理,还有ggcorrpl ...
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