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淡水:21世纪的分子微生物生态学
刘永鑫 2019-6-9 13:13
撰文:黄朝 西北大学 责编:刘永鑫 中科院遗传发育所 淡水:21世纪的分子微生物生态学 摘要 微生物无处不在,是具有生态意义的淡水环境分类和功能多样化的组成部分。淡水系统中的细菌,古细菌和真核微生物支持一系列生态过程和功能。然而,我们对微生物生态学知之甚少。随着人类新世纪的发展,对淡水的需 ...
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NAR:antiSMASH数据库2—次级代谢物基因簇预测
刘永鑫 2019-6-3 11:09
之前我们介绍过 《antiSMASH:微生物次生代谢物基因簇预测》 的使用实例和结果解读。此软件目前累计发表5篇NAR,引用超3千次。今天为大家带来了全新的antiSMASH数据库第二版。来看看有哪些更新和新功能。 antiSMASH数据库第2版:次级代谢产物生物合成基因簇的综合资源 The antiSMASH database version 2: a compr ...
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Science:中英合作揭示拟南芥三萜化合物特异调控根系微生物组
刘永鑫 2019-5-10 02:55
https://science.sciencemag.org/content/364/6440/eaau6389 继上周一,中科院遗传发育所白洋组与储成才组合作在水稻微生物组中取得突破进展,成果以Article形式发表于 Nautre Biotechnology 杂志,详见下文: Nat. Biotechnol.|中科院揭示籼粳稻根系微生物组与氮肥利用效率关系 本周五,中科院遗传发育所 ...
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ISME:病原菌介导植物根际有益微生物群落组装
刘永鑫 2019-5-5 10:23
撰文:文涛 南京农业大学 责编:刘永鑫 中科院遗传发育所 全文约1.6万字,读完需20分钟。 主编按:本文被评为ISME 2018年编辑部推荐最佳文章,同时被Nature出版集团精选为ISME和Nature Microbiology精选文章。1年引用了32次,是ISME自身影响因子水平的3倍多。强烈推荐阅读! 病原菌介导植物根际有益微生物群 ...
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NC:恢复菌群多样性或能降低耐药性
刘永鑫 2019-4-26 19:54
主编按:第一次看到此文的推送是因为它引用了我参与的QIIME2,当时并没有引起我多大注意,过几天一位同行发给我此文请教其中的分析思路。仔细一读,发现它的实验设计、分析非常全面。极其适合作为纯分析文章的图表整理学习模板,故精读此文,供同行学习与讨论。以下全文共有2.3万字,7个主图,1个表,21个附图,12个 ...
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Microbiome:根际微生物影响植物开花时间
刘永鑫 2019-4-21 18:20
根际微生物影响植物开花时间,文章的完成单位,浙江工业大学,中科院城市环境研究所。 文章的通讯作者是朱永官研究员 朱永官成功组建了中国科学院与澳大利亚首个联合实验室,并任首届主任(现任室主任为贺纪正研究员)。首次揭示了土壤—水稻体系中砷—磷—铁膜三者交互作用的机理,论文发表在著名国际刊物New Ph ...
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Nature综述:微生物构成的氮循环网络(必读)
刘永鑫 2019-4-21 16:08
微生物构成的氮循环网络 The microbial nitrogen-cycling network 翻译:翟志文 中科院遗传发育所 责编:刘永鑫 中科院遗传发育所 Nature Reviews Microbiology, https://doi.org/10.1038/nrmicro.2018.9 Published: 05 February 2018 第一作者:Marcel M. M. Kuypers 通讯作者:Marcel M. M. Kuype ...
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