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分享 包吃包住包机票的培训你见过吗?云南高通量条形码培训班,截止5月31日
刘永鑫 2019-4-3 21:24
2019年中国云南高通量条形码培训班 2019年云南高通量条形码培训班开始报名 感谢Doug Yu老师的组织 划重点 超值:全免费,包吃包住包机票 超强:老师来自本领域活跃的课题组,有丰富培训经验 超抢:全国15个名额,必须有一定的基础和合理的研究思路 注意本课程不包括细菌/古细菌/病毒的生物多样性 先看看往 ...
个人分类: 培训|461 次阅读|没有评论
分享 WebMGA:超快的基因组序列聚类注释在线工具
刘永鑫 2019-3-30 21:01
超快的基因组序列聚类注释在线工具WebMGA 撰文:周晗 中南大学 审稿:刘永鑫 中科院遗传发育所 (宏)基因组学是测序研究生物功能的新领域。如今测序技术一直在进步,成本也大幅下降,数据在大量增加,但数据分析是非常耗时的,并且(宏)基因组注释涉及广泛的计算工具,这些工具难以轻松掌握。少数可用Web服务器提 ...
个人分类: 宏基因组|824 次阅读|没有评论
分享 Nature综述:优先效应在生命早期肠道微生物组形成中的作用
刘永鑫 2019-3-26 22:40
优先效应在生命早期肠道微生物组的装配中的作用 Role of priority effects in the early-life assembly of the gut microbiota 翻译:秋芒树 英国帝国理工学院 责编:刘永鑫 中科院遗传发育所 原文链接: https://www.nature.com/articles/nrgastro.2017.173 Nature Reviews Gastroenterology Hepatology ...
个人分类: 读文献|632 次阅读|没有评论
分享 2019微生物组—宏基因组分析技术专题研讨会第四期
刘永鑫 2019-3-25 21:55
在广大粉丝的期待下,《生信宝典》联合《宏基因组》在 2019年6月21-23日,北京鼓楼 推出《 宏基因组分析 》专题培训第四期,为大家提供一条走进生信大门的捷径、为同行提供一个宏基因组分析学习和交流的机会、助力学员真正理解分析原理和完成实战分析,独创四段式教学(3天集中授课+自行练习2周+再集中讲解答疑+上 ...
个人分类: 培训|621 次阅读|没有评论
分享 R包circlize:柱状图用腻了?试试好看的弦状图
刘永鑫 2019-3-25 17:04
柱状图用腻了?试试好看的弦状图 作者:郑伟 西北农林科技大学 责编:刘永鑫 中科院遗传发育所 弦图简介 总体来讲,弦图是一种可视化微生物物种或基因相对丰度的方法。平时大多数时间我们看到的文章一般都用柱状图表示微生物或者基因的相对丰度,弦图和柱状图最大的区别就在于它不仅可以用来表示微生物物种或者基 ...
个人分类: R|994 次阅读|没有评论
分享 NAR:UNITE真菌鉴定ITS数据库——处理未分类和并行分类(数据库文章阅读模板)
刘永鑫 2019-3-25 06:48
上方文章标题要求:包括杂志名缩写(一个词的杂志名不缩写,两个及上用实词首字母)和吸引人且有重要信息的语句,中间用中文冒号(:)分隔 注:文中灰色部分(引用格式)为写作说明文字,帮助编辑规范Markdown语言创造笔记和完成必要的内容,在正式稿件中可删除 目录 ,用于把握全文的层级结构,方便导航 ;一般分为三 ...
个人分类: 读文献|429 次阅读|没有评论
分享 Microbiome:土壤微生物群落对有机和无机土壤改良剂和细菌入侵的恢复力
刘永鑫 2019-3-24 22:13
土壤微生物群落对有机/无机土壤改良剂和细菌入侵的恢复力 Resilience of the resident soil microbiome to organic and inorganic amendment disturbances and to temporary bacterial invasion 翻译:葛安辉 中科院生态环境中心 责编:刘永鑫 中科院遗传发育所 Microbiome, DOI: https://doi.org/10.118 ...
个人分类: 读文献|416 次阅读|没有评论
分享 GraPhlAn:最美进化树或层级分类树学习笔记
刘永鑫 2019-3-21 21:52
Graphlan可视化进化树 撰文:文涛 南京农业的大学 责编:刘永鑫 中科院遗传发育所 GraPhlAn简介 总体来讲,Graphlan是一个可视化进化树和基于分类等级绘制层级分类树的工具。可以制作分类树是它不同于R包ggtree和iTOL的地方。然就进化树而言,iTOL功能最为全面,ggtree最容易上手,从功能上来讲graphlan很多地方不 ...
个人分类: 软件|484 次阅读|没有评论
分享 MER:高通量测序应用于病原体和害虫诊断——综述与实用性建议
刘永鑫 2019-3-20 17:09
高通量测序应用于病原体和害虫诊断——综述与实用性建议 High‐throughput identification and diagnostics of pathogens and pests: Overview and practical recommendations 译者:中国科学院动物研究所 和平鸽 责任编辑:中国科学院遗传与发育研究所 刘永鑫 DOI: https://doi.org/10.1111/1755-0998.129 ...
个人分类: 读文献|1067 次阅读|没有评论

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