WebMGA：超快的基因组序列聚类注释在线工具

刘永鑫 2019-3-30 21:01

超快的基因组序列聚类注释在线工具WebMGA 撰文：周晗 中南大学 审稿：刘永鑫 中科院遗传发育所 （宏）基因组学是测序研究生物功能的新领域。如今测序技术一直在进步，成本也大幅下降，数据在大量增加，但数据分析是非常耗时的，并且（宏）基因组注释涉及广泛的计算工具，这些工具难以轻松掌握。少数可用Web服务器提 ...

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Nature综述：优先效应在生命早期肠道微生物组形成中的作用

刘永鑫 2019-3-26 22:40

优先效应在生命早期肠道微生物组的装配中的作用 Role of priority effects in the early-life assembly of the gut microbiota 翻译：秋芒树 英国帝国理工学院 责编：刘永鑫 中科院遗传发育所 原文链接： https://www.nature.com/articles/nrgastro.2017.173 Nature Reviews Gastroenterology Hepatology ...

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2019微生物组—宏基因组分析技术专题研讨会第四期

刘永鑫 2019-3-25 21:55

在广大粉丝的期待下，《生信宝典》联合《宏基因组》在 2019年6月21-23日，北京鼓楼 推出《 宏基因组分析 》专题培训第四期，为大家提供一条走进生信大门的捷径、为同行提供一个宏基因组分析学习和交流的机会、助力学员真正理解分析原理和完成实战分析，独创四段式教学(3天集中授课+自行练习2周+再集中讲解答疑+上 ...

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R包circlize：柱状图用腻了？试试好看的弦状图

热度 1 刘永鑫 2019-3-25 17:04

柱状图用腻了？试试好看的弦状图 作者：郑伟 西北农林科技大学 责编：刘永鑫 中科院遗传发育所 弦图简介 总体来讲，弦图是一种可视化微生物物种或基因相对丰度的方法。平时大多数时间我们看到的文章一般都用柱状图表示微生物或者基因的相对丰度，弦图和柱状图最大的区别就在于它不仅可以用来表示微生物物种或者基 ...

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NAR：UNITE真菌鉴定ITS数据库——处理未分类和并行分类(数据库文章阅读模板)

刘永鑫 2019-3-25 06:48

上方文章标题要求：包括杂志名缩写(一个词的杂志名不缩写，两个及上用实词首字母)和吸引人且有重要信息的语句，中间用中文冒号(：)分隔 注：文中灰色部分（引用格式）为写作说明文字，帮助编辑规范Markdown语言创造笔记和完成必要的内容，在正式稿件中可删除 目录 ，用于把握全文的层级结构，方便导航 ；一般分为三 ...

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Microbiome：土壤微生物群落对有机和无机土壤改良剂和细菌入侵的恢复力

刘永鑫 2019-3-24 22:13

土壤微生物群落对有机/无机土壤改良剂和细菌入侵的恢复力 Resilience of the resident soil microbiome to organic and inorganic amendment disturbances and to temporary bacterial invasion 翻译：葛安辉 中科院生态环境中心 责编：刘永鑫 中科院遗传发育所 Microbiome, DOI： https://doi.org/10.118 ...

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Microbiome：根系分泌物驱动土壤记忆抵御植物病原菌(作者解读)

刘永鑫 2019-3-19 20:10

根系分泌物驱动土壤记忆抵御植物叶际病原菌 Root exudates drive the soil-borne legacy of aboveground pathogen infection 撰文：文涛 南京农业大学 责编：刘永鑫 中国科学院遗传与发育生物学研究所 导读 根际作为土壤中微生物最为活跃的热区之一，不仅微生物的相互作用异常复杂，同时微生物同植物的互作 ...

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德国耶拿大学植物微生物组实验室急招博士生项目，申请截止19年3月20日

刘永鑫 2019-3-18 22:28

招聘信息原文： https://sites.google.com/view/microbiosis/now-hiring (本文中网址均为Google子网页，访问可能需要科学上网) Doctoral Researcher Position as part of the Jena Cluster of Excellence “Balance of the Microverse” (3.5 years, 65% TV-L E13): Timeline: Application deadline: 20th March, ...

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