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QIIME 2教程. 10数据导出ExportingData(2020.11): 刘永鑫 2021-1-24 22:05; QIIME 2用户文档. 10数据导出 https://docs.qiime2.org/2020.11/tutorials/exporting/ Exporting data 注：最好按本教程顺序学习，想直接学习本章，至少完成本系列 1简介和安装。为了使用QIIME 2，输入数据必须存储在QIIME 2对象（即 qza 文件）中。这是支持分布式、自动来源跟踪、语义类型验证和数据格式之 ...; 个人分类: QIIME2|1796 次阅读|没有评论

QIIME 2教程. 13训练特征分类器Training feature classifiers(2020.11): 刘永鑫 2021-1-24 22:04; 训练特征分类器 Training feature classifiers with q2-feature-classifier https://docs.qiime2.org/2020.11/tutorials/feature-classifier/ 注：最好按本教程顺序学习，想直接学习本章，至少完成本系列 1简介和安装。详者注：为什么要训练分类集？因为不同实验的扩增区域不同，鉴定物种分类的精度不同，提 ...; 个人分类: QIIME2|2431 次阅读|没有评论

QIIME 2教程. 12数据筛选Filtering data(2020.11): 刘永鑫 2021-1-24 20:48; QIIME 2用户文档. 12数据筛选 Filtering data https://docs.qiime2.org/2020.11/tutorials/filtering/ 注：此实例需要完成本系列文章《1简介和安装》本教程介绍如何过滤QIIME 2中的特征表、序列和距离矩阵，软件将随着更新，新增可用的过滤功能，从而不断扩大其应用范围。详者注：复杂的实验通常会有非常 ...; 个人分类: QIIME2|2160 次阅读|没有评论

QIIME 2教程. 11元数据Metadata(2020.11): 刘永鑫 2021-1-24 19:37; QIIME 2用户文档. 11元数据 Metadata in QIIME 2 https://docs.qiime2.org/2020.11/tutorials/metadata/ 注：此实例需要一些基础知识，要求完成本系列文章前两篇内容：《1简介和安装》和《4人体各部位微生物组分析》。详者注：什么是元数据？是描述数据的数据，样本信息是样本元数据，物种注释是特征元数 ...; 个人分类: QIIME2|3184 次阅读|没有评论

QIIME 2教程. 09数据导入Importing data(2020.11): 刘永鑫 2021-1-15 22:43; QIIME 2用户文档. 9数据导入 Importing data 原文地址： https://docs.qiime2.org/2020.11/tutorials/importing/ 为了使用QIIME 2，输入数据必须存储在 QIIME 2对象（即qza文件）中。这是实现支持分布式和自动来源跟踪、以及语义类型验证和数据格式之间的转换所必须（有关QIIME 2对象的更多详细信息，请参阅《1简 ...; 个人分类: QIIME2|5099 次阅读|没有评论

QIIME 2教程. 08差异丰度分析gneiss(2020.11): 刘永鑫 2021-1-15 22:23; QIIME 2用户文档. 8差异丰度分析gneiss Differential abundance analysis with gneiss 原文地址： https://docs.qiime2.org/2020.11/tutorials/gneiss/ 此实例需要一些基础知识，要求完成本系列文章前两篇内容：《 1简介和安装IntroductionInstall 》和《 4人体各部位微生物组分析MovingPicture 》。在本教 ...; 个人分类: QIIME2|2217 次阅读|没有评论

QIIME 2教程. 07Cell帕金森小鼠Parkinson\'s Mouse(2020.11，最佳实战): 刘永鑫 2021-1-12 22:27; QIIME 2用户文档. 7帕金森小鼠教程 Parkinson’s Mouse Tutorial 原文地址： https://docs.qiime2.org/2020.11/tutorials/pd-mice/ 本教程将使用来自人源化(humanized)小鼠的一组粪便样品，展示16S rRNA基因扩增子数据的“典型”QIIME 2分析。最初的研究， Sampson等，2016 旨在确定粪便微生物组是否有助于帕金森 ...; 个人分类: QIIME2|3352 次阅读|没有评论

QIIME 2教程. 06沙漠土壤分析AtacamaSoil(2020.11): 刘永鑫 2021-1-12 18:54; QIIME 2用户文档. 6阿塔卡马沙漠微生物组分析原文地址： https://docs.qiime2.org/2020.11/tutorials/atacama-soils/ 此实例需要一些基础知识，要求完成本系列文章前两篇内容：《 1简介和安装IntroductionInstall 》和《 4人体各部位微生物组分析Moving Pictures 》。本教程设计用于两个目的。首先，它描 ...; 个人分类: QIIME2|1917 次阅读|没有评论

QIIME 2教程. 05粪菌移植分析练习(FMT)(2020.11): 刘永鑫 2020-12-28 20:22; QIIME 2用户文档. 5粪菌移植分析练习 Fecal microbiota transplant (FMT) study: an exercise https://docs.qiime2.org/2020.11/tutorials/fmt/ 注意：本教程假定您已经完成 1简介和安装IntroductionInstall ，成功安装QIIME 2。本教程计划在完成《 4人体各部位微生物组分析MovingPicture 》之后练习。它旨 ...; 个人分类: QIIME2|2833 次阅读|没有评论

QIIME 2教程. 04人体微生物组分析Moving Pictures(2020.11): 刘永鑫 2020-12-28 20:21; QIIME 2用户文档. 4人体各部位微生物组 “Moving Pictures” tutorial https://docs.qiime2.org/2020.11/tutorials/moving-pictures/ 本节1.6万字，14张图，3个视频。阅读时间大约40分钟。注意：本文学习需要安装好QIIME 2，请务必完成 1简介和安装IntroductionInstall 在本教程中，你将使用QIIME 2在五 ...; 个人分类: QIIME2|7378 次阅读|没有评论

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