科学网

 找回密码
  注册
搜索
热搜: 科学 论文
搜索
分享 FM-2018-大熊猫的肠道菌群可能并没有特化出发酵纤维素的能力
刘永鑫 2019-1-30 10:08
宏基因组研究揭示大熊猫的肠道菌群可能并没有特化出发酵纤维的能力 撰文:和平鸽 中科院动物研究所 责编:刘永鑫 中科院遗传发育所 原文连接 Guo W, Mishra S, Zhao J, Tang J, Zeng B, Kong F, Ning R, Li M, Zhang H, Zeng Y and others. 2018. Metagenomic study suggests that the gut microbiota of the giant ...
个人分类: 读文献|724 次阅读|没有评论
分享 QIIME 2用户文档. 18使用q2-vsearch聚类OTUs(2018.11)
刘永鑫 2019-1-30 08:54
前情提要 QIIME 2可重复、交互和扩展的微生物组数据分析流程 1简介和安装Install 2插件工作流程概述Workflows 3老司机上路指南Experienced 4人体各部位微生物组分析Moving Pictures 5粪菌移植分析练习FMT 6沙漠土壤分析Atacama soil 7差异丰度分析gneiss 8数据导入Importing 9数据导出E ...
个人分类: QIIME2|658 次阅读|没有评论
分享 一作解读:EID-2017-宏基因组测序在新发腹泻病毒鉴定中的应用
刘永鑫 2019-1-29 17:49
宏基因组测序在新发腹泻病毒鉴定中的应用 撰文:李杰 常熟理工学院生物与食品工程学院 责编:刘永鑫 中科院遗传发育所 写在前面 发现和鉴定新病毒以及确定新病毒与疾病的关系是预防、诊断和治疗新发病毒性传染病的首要任务。高通量测序技术突破了传统技术方法的局限,可以直接以标本中所有的遗传物质为研究对象,从 ...
个人分类: 读文献|496 次阅读|没有评论
分享 QIIME 2用户文档. 17序列双端合并read-joining(2018.11)
刘永鑫 2019-1-29 09:32
前情提要 QIIME 2可重复、交互和扩展的微生物组数据分析流程 1简介和安装Install 2插件工作流程概述Workflows 3老司机上路指南Experienced 4人体各部位微生物组分析Moving Pictures 5粪菌移植分析练习FMT 6沙漠土壤分析Atacama soil 7差异丰度分析gneiss 8数据导入Importing 9数据导出E ...
个人分类: QIIME2|588 次阅读|没有评论
分享 Science新闻:肠道菌群又添一大功能,揭示你的真实年龄
刘永鑫 2019-1-28 16:23
肠道菌群又添一大功能,揭示你的真实年龄 撰文:陈亮 中科院微生物所 责编:刘永鑫 中科院遗传发育所 写在前面 日前从热心肠日报看到,Science杂志发了一则新闻:肠道里的细菌可能会揭示你的真实年龄,感觉非常有趣,遂下载原文仔细阅读一番。此文于2018年12月28日,发表于著名的预印本杂志bioRxiv上,Science杂志于20 ...
个人分类: 读文献|1472 次阅读|没有评论
分享 QIIME 2用户文档. 16鉴定和过滤嵌合体序列q2-vsearch(2018.11)
刘永鑫 2019-1-28 14:20
前情提要 QIIME 2可重复、交互和扩展的微生物组数据分析流程 1简介和安装Install 2插件工作流程概述Workflows 3老司机上路指南Experienced 4人体各部位微生物组分析Moving Pictures 5粪菌移植分析练习FMT 6沙漠土壤分析Atacama soil 7差异丰度分析gneiss 8数据导入Importing 9数据导出E ...
个人分类: QIIME2|561 次阅读|没有评论
分享 QIIME 2用户文档. 15进行纵向和成对样本比较q2-longitudinal(2018.11)
刘永鑫 2019-1-27 20:10
前情提要 QIIME 2可重复、交互和扩展的微生物组数据分析流程 1简介和安装Install 2插件工作流程概述Workflows 3老司机上路指南Experienced 4人体各部位微生物组分析Moving Pictures 5粪菌移植分析练习FMT 6沙漠土壤分析Atacama soil 7差异丰度分析gneiss 8数据导入Importing 9数据导出E ...
个人分类: QIIME2|1048 次阅读|没有评论
分享 宏基因组QIIME2专题讨论群
刘永鑫 2019-1-26 12:46
写在前面 宏基因组公众号负责QIIME 2 官方中文文档的更新。目前已经有更新了14章,近8万字(详见下方文章列表链接)。 鉴于QIIME 2的整体架构和使用方法与QIIME存在较大不同、QIIME 2仍存在一些不足,同时用户也积累了较多共性问题。 现成立QIIME 2中文微信讨论群,方便真正使用者间的经验交流。 扫描以下二维码。 备注 ...
个人分类: QIIME2|459 次阅读|没有评论
分享 QIIME 2用户文档. 14机器学习预测样品元数据分类和回归q2-sample-classifier(2018.11)
刘永鑫 2019-1-24 18:25
前情提要 QIIME 2可重复、交互和扩展的微生物组数据分析流程 1简介和安装Install 2插件工作流程概述Workflows 3老司机上路指南Experienced 4人体各部位微生物组分析Moving Pictures 5粪菌移植分析练习FMT 6沙漠土壤分析Atacama soil 7差异丰度分析gneiss 8数据导入Importing 9数据导出E ...
个人分类: QIIME2|1179 次阅读|没有评论
分享 最前沿的科学, 寻找最聪明的你—“宏基因组”公众号编辑招募
刘永鑫 2019-1-24 10:29
“宏基因组”公众号简介 宏基因组是当今世界科研最热门的研究领域之一,近年国际微生物组计划及其成果CNS专刊将本领域推向发展的黄金时代。随着中国微生物计划立项(香山会议)召开,“热心肠”等众多菌群研究公众号科普传播,使我国这一领域从政策到群众都有了强大基础。然而每位转向这一领域的研究人员在科研中,从 ...
个人分类: 新闻|428 次阅读|没有评论

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备14006957 )

GMT+8, 2019-7-16 12:06

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部