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OPERA-MS:宏基因组二、三代测序混合组装
刘永鑫 2020-9-17 19:02
之前详细介绍了宏基因组二、三代混合组装软件OPERA-MS的Nature Biotechnology文章。详见下文: NBT:宏基因组二、三代混合组装软件OPERA-MS 今天带来软件的使用经验,主要参考如下官方文档: https://github.com/CSB5/OPERA-MS 同时使用自己的数据进行经验分享。 简介 OPERA-MS是一种混合式宏基因组组装软 ...
个人分类: 三代测序|4014 次阅读|没有评论
NanoPlot:三代纳米孔测序数据质量评估
刘永鑫 2020-9-16 17:54
简介 二代测序最常用的质量评估软件是FastQC,多样本时可进一步结合MultiQC。此外速度超快的fastp也特别推荐,而且包括质量评估、质量控制等功能,可以说是国产软件之光,详见下方详细教程: 数据的质量控制软件——FastQC 整合QC质控结果的利器——MultiQC 极速的FASTQ文件质控+过滤+校正fastp 三代纳 ...
个人分类: 三代测序|6042 次阅读|没有评论

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