科学网

 找回密码
  注册
搜索
热搜: 科学 论文
搜索
中国核酸数据库GSA数据提交指南
刘永鑫 2020-2-13 23:22
中国核酸数据库GSA https://bigd.big.ac.cn/gsub/ GSA 数据模型 为确保与国际同类数据库系统的兼容性,GSA遵循INSDC联盟的数据标准,GSA元数据类别主要包括项目信息(BioProject,归档于生物项目数据库)、样本信息(BioSample,归档于生物样本数据库)、实验信息(Experiment)、以及测序反应(Run)信息。项目 ...
个人分类: Linux|478 次阅读|没有评论
Github上传大于100M文件:LFS
刘永鑫 2020-2-13 22:55
Git 简介 Git是目前世界上最先进的分布式版本控制系统。其原理如下所示: 首先我们安装git。官方下载位置 https://git-scm.com/ ,下载完成后我们按照普通软件安装即可: 安装完成之后我们的鼠标右键就会出现Git GUI/bash here选项: 创建项目并推送文件 首先我们来测试一下git上传普通文件的方法,为此 我 ...
个人分类: Linux|480 次阅读|没有评论
Linux Shell Tips小技巧
刘永鑫 2019-8-29 20:08
sed 指定行 sed -n '5,10{/pattern/p}' file 删除文本 # 删除第一行 sed '1d' temp.txt # 删除1-4行 sed '1,4d' temp.txt 替换文本 file文件中的第三行中的aaa替换为fff sed -i '3s/aaa/fff/' file 文件中找出包含xxx的行,并将其中的aaa替换为fff sed -i '/x ...
个人分类: Linux|734 次阅读|没有评论
[转载]linux统计分析命令datamash
刘永鑫 2019-6-24 21:14
本文转载自“生信菜鸟团” 引子 之前写 awk 教程的时候,曾经提到过一些对文本中行列进行某些计算统计的需求,例如使用数组分类求和。一些基本需求 awk 都可以实现,但是写起来稍显复杂。在 R 中使用 dplyr 或者基础函数 aggregate() 可以方便的进行分组操作,如果能在 linux 中使用更加简洁的单行命令针对数值和字 ...
个人分类: Linux|894 次阅读|没有评论
查看Linux中硬链的所有文件路径
刘永鑫 2019-3-7 20:46
一种解读 比对我有一个文件,显示存在3个硬链的位置。如何查找每个文件的位置呢? 因为硬链是对应同一个文件索引值,查看文件索引值,查查找相同索引值的文件 # 显示含有多个硬链文件的索引号 ls -i filename # 比对显示的索引值为286752868 # 根据显示的索引号在指定范围内查找 find ~ -inum 286752868 实例: ...
个人分类: Linux|577 次阅读|没有评论
查看服务器硬盘负载——判断硬盘是否为瓶颈
刘永鑫 2018-11-30 19:46
top 平时我们top查看内存使用(KiB Mem),CPU负载(load average),那个显示的是硬盘呢? %Cpu(s): 0.5 us, 0.2 sy, 0.0 ni, 96.7 id, 2.6 wa, 0.0 hi, 0.0 si, 0.0 st CPU的wa(wait等待)越大代表硬盘、内存读写等待时间,一般内存比硬盘读写快一个数量级,基本都是在等硬 ...
个人分类: Linux|2037 次阅读|没有评论
Linux下取代top的进程管理工具 htop
刘永鑫 2018-11-20 18:54
简介 htop 是Linux系统中的一个可交互式的进程查看工具,纯文本模式的应用程序,无需图形界面,但效果和有图形一样棒。 与Linux传统的top相比,htop更加人性化。它可让用户交互式操作,支持颜色主题,可横向或纵向滚动浏览进程列表,并支持鼠标操作。 与top相比,htop有以下优点: 可以横向或纵向滚动浏览进程列 ...
个人分类: Linux|1421 次阅读|没有评论
R,Git和Github(下)
刘永鑫 2018-6-18 12:15
作者:Wenhu 博客: http://bioinfostar.com/ 本讲第一部分,介绍git的“足够你用”命令;本讲为第二部分,介绍github的主要用途,包括版本管理、分枝管理等,以及推荐的在Rstudio中使用git的教程,部分内容改编自廖雪峰的 《Git教程》 。 欢迎转载,但请注明出处! 源代码: https://github.com/mckf111/mckf111.g ...
个人分类: Linux|1750 次阅读|没有评论
R,Git和Github(上)
刘永鑫 2018-6-17 21:59
作者:Wenhu 博客: http://bioinfostar.com/ 本讲为第一部分,介绍git的“足够你用”命令;第二部分,还将介绍github的主要用途以及如何在R中使用git,部分内容改编自廖雪峰的 《Git教程》 。 源代码: https://github.com/mckf111/mckf111.github.io/tree/master/_posts Git是啥 正统解释: 分布式版本控制系 ...
个人分类: Linux|1339 次阅读|没有评论
Windows10远程桌面Ubuntu16.04
刘永鑫 2018-5-29 22:33
自己的笔记本配置太低,有很多图形界面的软件,需要在服务器上运行,通常只用SSH方式访问的命令行方式是无法实现的。 虽然配置XShell + XManager可以实现打开图形程序,但速度之慢,即使内网也无法忍受。 今天来推荐一个更高效的远程桌面方法,让你把服务器当成自己笔记本用,可以强大到爆炸。 远程桌面方法最好内网使 ...
个人分类: Linux|4757 次阅读|没有评论

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2020-5-29 16:34

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部