科学网

 找回密码
  注册
搜索
热搜: 科学 论文
搜索
分享 基于Cytoscape的GIANT增强包分析网络图的Z、P-score
刘永鑫 2019-4-21 17:05
基于Cytoscape的GIANT增强包分析网络图的 Zi 、 Pi -score 作者:郑伟 西北农林科技大学 责编:刘永鑫 中科院遗传发育所 Zi 、 Pi score值简介 Zi 、 Pi score值的基本概念 Zi 、 Pi score值中 Zi 指的是within-module connectivity,而 Pi 指的是among-module connectivity。他们一起用来表示network中每个no ...
个人分类: 编程|557 次阅读|没有评论
分享 R语言:数据筛选match
刘永鑫 2018-12-9 13:27
数据筛选是在分析中最常用的步骤,如微生物组分析中,你的OTU表、实验设计、物种注释之间都要不断筛选,来进行数据对齐,或局部分析。 今天来详解一下此函数的用法。 match match:匹配两个向量,返回x中存在的返回索引或TRUE、FALSE match函数使用格式有如下两种: 第一种方便设置参数,返回x中元素在table中的位置 ...
个人分类: 编程|915 次阅读|没有评论
分享 生信人值得拥有的编程模板-Perl
刘永鑫 2017-10-9 15:16
为什么要学编程 图1. 重复工作任务量与时间关系 如上图,对于大量重复工作,非编程者(non-geek)工作量和时间是正相关的,就像富士康流水线上的工人,这种工作对于高智商的人是无法忍受(富士康招流水线工人会测智商,高智商不会被分配大量重复工作,容易离职)。而编程者(geek)会分三个阶段:手工操作摸索规律(与non-g ...
个人分类: 编程|1497 次阅读|没有评论
分享 生信人写程序2. Editplus添加Perl, Shell, R模板和语法高亮
刘永鑫 2017-7-4 15:28
科学网对Markdown排版支持较差,对格式不满意的用户请跳转至 CSDN 或 “生信宝典”公众号 阅读; 想了解更多宏基因组、16S分析相关文章,快关注“宏基因组”公众号,干货第一时间推送。 系统学习生物信息,快关注“生信宝典”,那里有几千志同道合的小伙伴一起学习。 前言 “工欲善其事必先利其器”,生信工程 ...
个人分类: 编程|2675 次阅读|没有评论
分享 生信人写程序1. Perl语言模板及配置
刘永鑫 2017-6-24 18:38
科学网对Markdown排版支持较差,对格式不满意的用户请跳转至 CSDN 或 微信 阅读; 如果感觉文章对您有帮助,想继续阅读同类文章,请扫描下方二维码关注“生信宝典”公众号,每天接收最新生物信息学原创文章。只关注宏基因方向的用户请微信搜索“宏基因组”公众号添加。 生物信息领域常用语言 个人认为:是否能熟 ...
个人分类: 编程|2365 次阅读|没有评论

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备14006957 )

GMT+8, 2019-7-23 04:45

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部