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科研统计与绘图的利器:R语言,你值得拥有

已有 1038 次阅读 2020-3-28 08:49 |个人分类:心灵寄语|系统分类:论文交流| 科研, 学术, SCI论文写作与发表, 科研绘图

投必得学术在本期与大家分享一个强大的科研统计与绘图的利器-R语言。什么是R语言呢?R语言是一个主要用于统计分析、绘图、报告的编程语言和操作环境,已经成为世界上使用人数最为广泛的统计编程语言。不论是统计分析,还是数据的可视化,现在都可以用R语言进行处理。

目前,R网站上大约有2100个程序包,在基础统计学、社会学、经济学、生态学、地理学、以学统计、生物信息学等各个科研领域都有广泛的应用。因此,学好R语言,对你的学术生涯都很有帮助。

接下来,我们将就R语言的基本概况特点、R语言在统计和绘图中的应用,以及R语言自学途径给大家一一介绍,帮助大家快速入门R语言,让R语言在你的科研之路上助你一臂之力。

1、R语言的基本概况特点,这些常识,你知道吗?

  • ①集统计分析和图形显示为一体,免费,源代码开放的软件。

  • ②可以支持各个操作系统,包括UNIX, LINUX, MacOS, WINDOWS。

  • ③R语言需要输入命令,可以编写函数和脚本进行批处理运算,语法简单灵活。

  • ④R语言的最常用的脚本编辑器:R studio,整合了很多R的功能在其中,比如查看帮助文档、帮助作图、语法高亮、缩进等功能。对初学者来说易于上手。一般用R语言和R studio来配置R语言运行环境。

  • ⑤所有的R的函数和数据集保存在程序包里,R包是多个函数的集合,具有详细的说明和示例。特定的分析功能,需要用相应的程序包来实现,比如群落生态学用Vggan包,高级绘图用ggplot2包等等。每个程序包都包含R函数、数据、帮助文件、描述文件等。

2、学习R语言初阶的几层境界

  • ①R和Rstudio的软件下载和安装。听说有一大批的想学习R的小伙伴都止步于这一步,完成这一步已经把R给攻克了一半啦。

  • ②了解R语言的界面及设置、工作空间的保存与打开、外部数据如何导入。

  • 这一步最快的入门方法是拿着一本R的教材把这三个章节内容系统地顺一遍,了解R的功能界面的常用操作,自己试着建立和保存工作空间、导入一下数据,很快就能掌握。

  • ③熟记R的基本语法,如命令、对象命名规则、函数、数据结构与类型、程序包、能够处理简单的R的报错。R的语法可以算得上诸多编程语言里最简单容易上手的了,如果熟悉其他编程语言,R语言很轻松就能玩转;如果之前没有编程基础,建议抽时间把这些语法功能背一背,用的时候可以足够灵活得应用于自己代码的编写当中。

  • ④阅读大量的自己领域内应用到R语言的文献,了解相关R包的基本内容,跟着文献的绘图,自己尝试着重现数据内容。

3、R语言的自学途径

  • ①善用R语言的经典教程《R语言实战》《R数据科学》 《R in action》,帮你了解R语言的基本操作和语法。

  • ②善用网上的R语言相关视频教程,在腾讯课堂或者B站上有大量关于R语言的入门与进阶教程,小伙伴们可以根据自己的实际情况来选择,坚持跟着一个系列操作下来,一定能帮你进入R语言的世界。

  • ③查看R的help文档和自带的R包进行R语言学习。关于如何查看R语言帮助文档的方式有很多,这里介绍最简单容易记的一种。即在想要查看的函数前打一个问号,回车,即能看到相应的函数使用介绍,下图以t检验为例做了演示。同时,小伙伴们也可以在R网站上下载R包的PDF手册进行学习。另外,Rstudio也出了一个learnr包和swirl包,把软件文档变成交互式的动态学习文档,有兴趣的小伙伴们可以试一下呀。

  • ④善用R语言的官方资源(https://www.rdocumentation.org/) 进行学习,平时多关注一下生物信息学、统计学、编程学的论坛、博客以及公众号进行学习。

  • ⑤当然,这里也推荐投必得公司关于R语言与生物信息学的系列公开课,带着你一步步地把R语言和生物信息学科研相关的内容打一遍基础。

投必得的文章写作系列会每周推出一篇跟大家科研写作息息相关的文章,如果您有具体问题,欢迎在评论部分讨论。

投必得学术本周特别邀请到文涛博士为大家分享“科研绘图与统计”的心得,让您在科研统计与作图的路上少一些弯路,多一些套路。另外,本次直播依然会有幸运抽奖,并且大家可以通过分享直播卡片(二维码)来邀请自己的好友加入直播间,我们会对邀请好友较多的读者有额外奖励!

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