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VASP+Phonopy计算声子谱、偏态密度
1. 首先得到力FORCE_SETS/CONSTANTS
VASP-INCAR文件-用于计算声子谱前的优化
System = ***
PREC = Accurate
ENCUT = 400.0
LREAL = .False
ISMEAR = 0
SIGMA = 0.05
EDIFF = 1E-7
EDIFFG = -1E-3
NSW = 50
ISIF = 3
IBRION = 2
VASP INCAR文件: DFPT in VASP- used to calculated phonon spectrum
System = ***
PREC = Accurate
ENCUT = 400.0
LREAL = .False
ISMEAR = 0
EDIFF = 1E-7
NSW = 1
IBRION = 8
LWAVE = .FALSE
LCHARG = .FALSE
ADDGRID = .TRUE
VASP POSCAR文件:cp SPOSCAR POSCAR(优化)
【应确保设置的KPOINTS产生的NKPTS个数达到20个左右。NKPT保持20个左右时,kmesh可取在0.04~0.05之间的某一数值,对计算结果影响不大,但相比0.03取值,可显著提高计算速度!!
优化完毕,check OUTCAR文件中的频率,如果频率行包含i,则表明存在虚频;需修改参数继续优化,以检查是否是由于参数设置不当引起的虚频。如:grep 'cm-1' OUTCAR】
对SPOSCR优化计算完成后,执行操作为: phonopy --fc vasprun.xml,得到FORCE_CONSTANTS
VASP INCAR文件:冷冻原子法 used to calculated phonon spectrum
ENCUT = 400.0
LREAL = .False
ISMEAR = 0
EDIFF = 1E-7
NSW = 0
IBRION = 1
LWAVE = .FALSE
LCHARG = .FALSE
VASP POSCAR文件:cp POSCAR-00i POSCAR(优化)
对POSCR-00i静态计算完成后,执行操作为: phonopy --f $i/vasprun.xml得到FORCE_SETS
(or phonopy-f disp-{001..003}/vasprun.xml)
2. 得到带结构所需文件及操作
带结构所需文件:band.conf FORCE_SETS/CONSTANTS POSCAR(扩胞前胞)
其中band.conf内容如下:
ATOM_NAME = Ti S
DIM = 2 3 2
BAND =000 0.500 0.50.50 000 00.50 00.50.5 000 000.5
BAND_LABELS= G Y C G Z D G B
FORCE_CONSTANTS = WRITE
BAND_CONNECTION = .TRUE.
操作:1) phonopy -p --factor=521.471 band.conf 得到band.yaml
>bandplot --gnuplot >Phononband.dat 将band.yaml转化为可用orgin绘图的数据文件
3. 得到声子谱态密度所需文件及操作
所需文件: mesh.conf FORCE_SETS POSCAR(扩胞前的Unitcell)
其中mesh.conf内容如下:
ATOM_NAME = Ti S (POSCAR原子分布 Ti Ti S S S S S S )
DIM = 2 3 2
MP =20 20 20 (大一些)
PDOS = 1 2, 3 4 5 6 7 8 (逗号隔开表示态密度按原子种类投影)
FORCE_CONSTANTS = READ
操作:phonopy -p --factor=521.471 mesh.conf,直接出来partial_dos.dat数据,用gnuplot作图
(1THz=4..413566meV http://halas.rice.edu/conversions)
plot "partial_dos.dat" u 1:($2+$3) w l lw 3 pt 4 ps 1.5 t 'Ti', "partial_dos.dat" u 1:($4+$5+$6+$7+$8+$9) w l lw 3 pt 8 ps 1.5 t 'S', "partial_dos.dat" u 1:($1+$2+$4+$5+$6+$7+$8+$9) w l lw 3 pt 6 ps 1.5 t 'Total'
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