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Nature Plants:拟南芥核被膜的蛋白质组全景图

已有 3394 次阅读 2020-7-5 16:29 |个人分类:每日摘要|系统分类:论文交流

Global profiling of plant nuclear membrane proteome in Arabidopsis

第一作者Yu Tang

第一单位加州大学伯克利分校

通讯作者Yangnan Gu


 Abstract 


背景回顾+问题The nuclear nevelope (NE) is structurally and functionally vital for eukaryotic cells, yet its protein constituents and their functions are poorly understood in plants.


主要研究:Here, we combined subtractive proteomics and proximity-labelling technology coupled with quantitative mass spectrometry to understand the landscape of NE membrane proteins in Arabidopsis.


结果总结:We identified ~200 potential candidates for plant NE transmembrane (PNET) proteins, which unravelled the compositional diversity and uniqueness of the plant NE.


重点蛋白:One of the candidates, named PNET1, is a homologue of human TMEM209, a critical driver for lung cancer. A functional investigation revealed that PNET1 is a bona fide nucleoporin in plants. It displays both physical and genetic interactions with the nuclear pore complex (NPC) and is essential for embryo development and reproduction in different NPC contexts.


结论:Our study substantially enlarges the plant NE proteome and sheds new light on the membrane composition and function of the NPC.


 摘  要 


核被膜(nuclear envelope)对于真核细胞来说,在结构和功能上都具有非常重要的作用,然而植物中核被膜的蛋白组成以及功能却了解得很少。本文中,作者结合消减蛋白组、邻近标记技术以及定量质谱获取了拟南芥中核被膜膜蛋白的全景图。作者鉴定到了约200个潜在的植物核被膜跨膜蛋白候选蛋白,揭示了植物核被膜成分的多样性和独特性。其中一个候选蛋白,命名为PNET1,其是人类TMEM209的同源蛋白,该蛋白在人类中是肺癌的主要驱动因子。功能研究显示拟南芥的PNET1蛋白是一个核孔蛋白。其在物理上和遗传上都能够与核孔复合体NPC互作,并且其与不同的NPC互作作用于植物的胚胎发育以及生殖过程。本文的研究极大的扩增了植物核被膜的蛋白质组,并且进一步揭示了植物核孔复合体的膜组成及功能。


 通讯作者 


**Yangnan Gu**


个人简介:

2007年,西安交通大学,学士;

2013年,印第安纳大学伯明顿分校,硕士;

2013年,印第安纳大学伯明顿分校,博士


研究方向:

植物细胞在核边界上对于免疫和胁迫响应的调控


doi: 10.1038/s41477-020-0700-9


Journal: Nature Plants

Published date: June 29, 2020



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