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博文

动物基因组测序进展

已有 4511 次阅读 2015-9-21 09:45 |系统分类:科研笔记

已发表动物基因组信息收录

http://blog.sina.com.cn/s/blog_ca4f97b40101pn9o.html


 

截止2013年10月已发表动物基因组信息收录(119)

中文名拉丁名发表时间 刊物科、属基因组大小
秀丽隐杆线虫Caenorhabditis elegans1998.12Science小杆总科、Caenorhabditis亚属97M
黑腹果蝇Drosophila melanogaster2000.03Science果蝇科、果蝇属180M
冈比亚按蚊Anopheles gambiae2002.10Science 蚊科、按蚊属280M
小家鼠Mus musculus2002.12Nature 鼠科2.5 G
红鳍东方豚Fugu rubripes2002.12Science 鲀科、东方鲀属380M
玻璃海鞘Ciona intestinalis2002.12Science 海鞘纲150M
线虫Caenorhabditis briggsae2003.11PLoS BiologyCaenorhabditis亚属104M
大鼠Rattus norvegicus2004.04Nature 啮齿目、鼠科2.75 G
黑斑鲀Tetraodon nigroviridis2004.10Nature 鲀科340M
家蚕Bombyx mori2004.12Science鳞翅目、蚕蛾科428.7 M
鸡Gallus sonneratii2004.12Nature雉科、原鸡属1.06G
拟暗果蝇Drosophila pseudoobscura2005.01Genome research果蝇科、果蝇属139M
克氏锥虫Trypanosoma cruzi2005.07Science锥虫属67M
黑猩猩Pan troglodytes2005.09Nature 猩猩科、黑猩猩属2.7G
狗Canis familiaris2005.12Nature 犬科、犬属2.5 G
意蜂Apis mellifera2006.10Nature昆虫纲236M
海胆Strongylocentrotus purpuratus2006.11Science海胆纲1G
姥鲨Callorhinchus milii2007.04Plos Biology软骨鱼纲、银鲛目0.91G
猕猴Macaca mulatta2007.04Science 猴科、猕猴属2.87G
短尾负鼠Monodelphis domestica2007.05Nature 负鼠科、短尾负鼠属3.4G
青鳉鱼Oryzias latipes2007.06Nature青鳉属700M
伊蚊Aedes aegypti2007.06Science 蚊科、伊蚊属1376M
马来线虫Brugia malayi2007.07Science 线虫纲90M
海葵Nematostella vectensis2007.07Science 海葵目357M
12种果蝇基因组进化分析(10种新)D.sechellia,D.simulans2007.11Nature果蝇科、果蝇属　
猫Felis catus2007.11Genome Research 猫科、猫属2.7G
赤拟谷盗Tribolium castaneum2008.04Nature 鞘翅目、拟步行虫科、拟谷盗属204M
鸭嘴兽Ornithorhynchus anatinus2008.05Nature 鸭嘴兽科、鸭嘴兽属1.84G
文昌鱼Branchiostoma floridae2008.06Nature 文昌鱼科、文昌鱼属520M
丝盘虫Trichoplax adhaerens2008.08Nature 丝盘虫科、丝盘虫属104M
根结线虫Meloidogyne incognita2008.08Nature Biotechnology线虫属86M
古猛犸象Mammuthus primigenius2008.11Nature 象科、猛犸象属4.7G
牛Bos taurus2009.04Science 牛科、牛属2.87 G
裂吸虫Schistosoma mansoni2009.07Nature 血吸虫属360M
血吸虫Schistosoma japonicum2009.07Nature 血吸虫属397M
马Equus caballus2009.11Science 马科、马属2.7G
熊猫Ailuropoda melanoleura2010.01Nature 熊科、大熊猫属2.25G
金小蜂Nasonia vitripennis, N. giraulti, N. longicornis2010.01Science 膜翅目、金小蜂科295M
豌豆蚜虫Acyrthosiphon pisum.2010.02PLoS Biology　517M
水螅Hydra2010.03Nature 水螅科、水螅属1.05G
非洲爪蟾Xenopus tropicalis2010.04Science负子蟾科、非洲爪蟾属1.7 G
珍珠鸟Taeniopygia guttata2010.04Nature 文鸟科、梅花雀属1.2G
人类体虱Pediculus humanus humanus2010.07PNAS人虱属110M
海绵Amphimedon queenslandica2010.08Nature多空动物门190M
蚂蚁Camponotus floridanus ,Harpegnathos saltator2010.08Science蚁科C. floridanus240 Mb; H. saltator330 Mb
火鸡Meleagris gallopavo2010.09PLoS Biology吐绶鸡科、吐绶鸡属1.1 Gb
库蚊Culex quinquefasciatus2010.10Nature蚊科、库蚊属540M
异体住囊虫Oikopleura2010.11Science脊索动物门、被囊动物亚门148M
红毛猩猩Pongo abelii 、Pongo pygmaeus2011.01Nature猩猩科3.09G
阿根廷蚁Linepithema humile2011.01PNAS蚁科250.8M
红色收割蚁Pogonomyrmex barbatus2011.01PNAS蚁科250–284 M
火蚁Solenopsis invicta2011.01PNAS蚁科484.2M
水蚤Daphnia pulex2011.02Science甲壳纲，鳃足亚纲，水蚤科200M
大头切叶蚁Atta cephalotes2011.02PLoS Genetics蚁科300M
旋毛虫Trichinella spiralis2011.02Nature Genetics 毛形科、毛形属64M
袋獾Sarcophilus harrisii2011.06PNAS袋獾属3.3G
顶切叶蚁Acromyrmex echinatior2011.06Genome Research 顶切叶蚁属313M
鹿角珊瑚Acropora digitifera2011.07Nature珊瑚虫纲420M
巨蟒Python molurus bivittatus2011.07Genome Biology 爬行纲1.4G
大西洋鳕鱼Gadus morhua2011.08Nature鳕形目、鳕属830M
澳大利亚袋鼠Macropus eugenii2011.08Genome Biology有袋目、袋鼠科2.9G
绿蜥蜴Anolis carolinensis2011.09Nature爬行纲、有鳞目1.78G
裸鼹鼠Heterocephalus glaber2011.10Nature啮齿目裸鼹鼠属2.6G
食蟹猴和中国恒河猴Macaca fascicularis,Macaca mulatta lasiota2011.10Nature Biotechnology猴科、猕猴属2.85G
猪蛔虫Ascaris suum2011.10Nature蛔虫属272M
二斑叶螨(棉红蜘蛛)Tetranychus urticae2011.11Nature叶螨科、叶螨属90M
帝王蝶Danaus plexippus2011.11Cell斑蝶属273M
指猴(夜狐猴)Daubentonia madagascariensis2011.12Genome Biology and Evolution指猴属3G
鲶鱼Ictalurus punctatus2011.12BMC Genomics鲶科、鲶属1G
埃及血吸虫Schistosoma haematobium2012.01Nature Genetics 血吸虫属385M
中华肝吸虫Clonorchis sinensis2011.10Genome Biology 线虫纲516M
鳄鱼Crocodylus siamensis2012.01Genome Biology爬行纲、鳄目2.5G
马氏珠母贝Pinctada fucata2012.02DNA Research珍珠贝科、珠母贝属
1150M
大猩猩Gorilla gorilla gorilla2012.03Nature 猩猩科3.04G
三刺鱼Gasterosteus aculeatus2012.04Nature 刺鱼目、刺鱼科、刺鱼属463M
诗神袖蝶Heliconius melpomene2012.05Nature 蛱蝶科、 釉蛱蝶属269M
倭黑猩猩Pan paniscus2012.06Nature 猩猩科、黑猩猩属2.7G
虎皮鹦鹉Melopsittacus undulatus2012.07Nature Biotechnology鹦鹉科、虎皮鹦鹉属1.2G
牦牛Bos grunniens2012.07Nature Genetics 牛科、牛属2.66G
北极熊Ursus maritimus2012.07PNAS熊科、棕熊属2.53G
间日疟原虫Plasmodium vivax2012.08Nature Genetics 疟原虫科、疟原虫属Brazil I 28.87Mb; India VII 29.25Mb; Mauritania I 28.43Mb; North Korean 29.65Mb
食蟹猴疟原虫Plasmodium cynomolgi2012.08Nature Genetics 疟原虫科、疟原虫属26.2Mb
勇地雀Geospiza fortis2012.08GigaScience地雀属1.07 Gb
牡蛎Crassostrea gigas2012.09Nature 软体动物门、牡蛎科559 Mb
姬鹟 Ficedula albicollis2012.10Nature 鹟科、姬鹟属1.13Gb
毛里求斯果蝇Drosophila mauritiana2012.10Genome Research果蝇科、果蝇属　
骆驼Camelus bactrianus 2012.11Nature Communications骆驼科、骆驼属、双峰驼种2.38Gb
家猪Sus scrofa2012.11Nature 猪科、猪属2.6Gb
五指山猪Sus scrofa2012.11GigaScience猪科、猪属2.6 Gb
帽贝、海蠕虫、淡水水蛭Lottia gigantea, Capitella teleta, Helobdella robusta2012.12Nature 软体动物、腹足纲；环节动物、多毛纲；环节动物、蛭纲、水蛭科348Mb,324Mb,228Mb
蝙蝠 Pteropus alecto，Myotis davidii2012.12Science狐蝠科；蝙蝠科、鼠耳蝠属2.00Gb，1.94Gb
家山羊Capra hircus2012.12Nature Biotechnology牛科、羊亚科、山羊属2.92G
小菜蛾Plutella xylostella2013.01Nature Genetics鳞翅目、菜蛾科343Mb
鸽子Columba livia2013.01Science鸠鸽科、鸽属1.3 Gb
树鼩Tupaia belangeri2013.02Nature Communications树鼩科、树鼩属3.2Gb
七鳃鳗Petromyzon marinus2013.02Nature Genetics七鳃鳗科816Mb
四种绦虫Echinococcus multilocularis;E. granulosus;Taenia solium ;Hymenolepis microstoma2013.03Nature扁形动物门、绦虫纲115-141Mb
游隼、猎隼Falco peregrinus;Falco cherrug2013.03Nature隼科、隼属1.2Gb
西部锦龟Chrysemys picta bellii2013.03Genome Biology 沼泽龟科、锦龟属

2.59Gb
山松甲虫Dendroctonus ponderosae Hopkins2013.03Genome Biology 鞘翅目、小蠹科208 Mb
月光鱼Xiphophorus maculatus2013.03Nature Genetics花鳉科、剑尾鱼属750–950 Mb
地山雀Pseudopodoces humilis2013.03Genome Biology 山雀科、地山雀属1.1 Gb
斑马鱼Danio rerio2013.04Nature鲤科、鱼丹属1.4 Gb
腔棘鱼Latimeria chalumnae2013.04Nature矛尾鱼科2.86 Gb
中华鳖和绿海龟Pelodiscus sinensis ;Chelonia mydas2013.04Nature Genetics鳖科、中华鳖属；海龟科、海龟属 2.21 Gb;2.24Gb
藏羚羊Pantholops hodgsonii2013.05Nature Communications牛科、藏羚属2.75 Gb
绯红金刚鹦鹉Ara macao2013.05PLoS ONE鹦鹉科、金刚鹦鹉属1.11–1.16 Gbp
北京鸭Anas platyrhynchos2013.06Nature Genetics鸭科、鸭属1.2 Gb
按蚊Anopheles darlingi2013.06Nucleic Acids Research蚊科、按蚊属201 Mb
太平洋蓝鳍金枪鱼Thunnus orientalis2013.06PNAS鲭科、金枪鱼属800 Mb
地山雀 Parus humilis2013.07Nature Communications山雀科、地山雀属1.08G
蛭形轮虫Adineta vaga2013.07Nature轮虫纲244 Mb
扬子鳄Alligator sinensis2013.08Cell Research短吻鳄科、短吻鳄属2.3 Gb
中国仓鼠Cricetulus griseus2013.08Nature Biotechnology仓鼠科2.33 Gb
布氏鼠耳蝠Myotis brandtii2013.08Nature Communications蝙蝠科、鼠耳蝠属2 Gb
捻转血矛线虫Haemonchus contortus2013.08Genome Biology 毛圆科、血矛属320 Mb
细粒棘球绦虫Echinococcus granulosus2013.09Nature Genetics带科、棘球属151.6 Mb
东北虎Panthera tigris 2013.09Nature Communications猫科、豹属2.4G
东亚钳蝎Mesobuthus martensii2013.10Nature Communications钳蝎科、钳蝎属1.3G





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