博文
- 中国科学院昆明植物研究所首次发现被子植物雄性偏向基因的快速演化
- 性二态（亦称 “ 第二性征 ” ）是雌雄异体的生物个体在繁殖器官以外的形态、生理和生活史等方面所呈现的差异化特征，它通常源于性别偏向基因的差异表达。相关的工作最早始于模式动物果蝇的性别偏向基因鉴定和演化特征分析，研究发现在正选择和放松的纯化选择作用下，雄性偏向基因显示出较快的蛋白质序列演化速率。由 ...
- 天南星科系统发育及全基因组复制事件
- 天南星科（包括浮萍类，但不包括菖蒲属）约有 144 属 3645 种，是单子叶植物泽泻目最为多样化的类群之一，具有多样的形态和生态习性。 在分子系统学兴起之前，菖蒲属长期被置于天南星科，目前已被证实为单子叶植物最早分化的类群； 浮萍类则常长期被处理成独立的科。 此前的研究表明天南星科的祖先栖息地与水生或 ...
- eLife文章终于尘埃落定
- 热度 1
- eLife文章，今天终于尘埃落定，编辑让我们VOR了。回想起这篇文章，光投稿就折腾了一年时间。从New Phytologist（送审，一个大修改，一个拒稿）， MBE（送审), JIPB, Plant Comm。最后，实在不想折腾了，并想体验一下eLife的新模式，就投了eLife。两周后，送审，但修改，就来来回回修改了4次。下面把每个期刊 ...
- [转载]How to Run TGICL
- http://sourceforge.net/projects/tgicl/ A sample LSF script file jobfile to cluster a EST dataset using TGICL on lewis may include the following lines: tgicl fastdb where fastdb the multi-fasta file containing all the sequences to be clustered. For more ...
- [转载]EST序列拼接流程
- http://blog.sina.com.cn/s/blog_4476400f0100iq0x.html EST----》 对EST序列进行冗余查找，利用CD_HIT软件聚类，快速批量去除冗余序列 est-trimer（去掉帽子和尾巴，去掉太短而不可信的）------》 RepeatMaster（去掉转座子等重复）-----》 seqclean（去除载体，线粒体叶绿体等序列）------》 CAP3(拼接 ...
- [转载]将序列比对的结果保存为漂亮的图片
- http://meons.blog.163.com/blog/static/201207004201081201340595/ 多序列比对在分子生物学中是一个基本方法，用来发现特征序列，进行蛋白分类，证明序列间的同源性，帮助预测新序列二级结构与三级结构，确定PCR引物，以及在分子进化分析方面均有很大帮助，Clustal W（Dos版本）很适合这些方面的要求，Clustal X是wi ...
- [转载]常用软件绘制高质量 （DPI） 图片
- 常用软件绘制高质量 （DPI） 图片 （Matlab,VISIO,POWERPOINT,MsWORD,MsEXCEL）for printed paper http://kalmanfans.is-programmer.com/posts/32308.html 本文主要介绍常见绘图工具（Matlab,VISIO,POWERPOINT,MsWORD,MsEXCEL）获取高质量图片的方法。同时，笔者根据以往经验，对不同图片格式对图片打印效果进行简要 ...
- RAD-Seq技术及分析软件
- http://en.wikipedia.org/wiki/Restriction_site_associated_DNA_markers http://ngs-expert.com/tag/rad-seq/ https://www.wiki.ed.ac.uk/display/RADSequencing/Home http://bbs.sciencenet.cn/home.php?mod=spaceuid=491809do=blogid=444728 http://datadryad.org/resource/do ...
- [转载]三代基因组测序技术原理简介
- http://www.cnblogs.com/huangshujia/p/3233693.html 【写在前面的话】：首先，这一篇博文中的内容并非原创，而是对多篇文献中内容的直接摘录，有些图片和资料还来自身边的同事（在此深表谢意！），再夹杂自己的零星想法，写在这里分享与大家，同时也是为了方便自己日后若有需要能够方便获得，文章比较 ...
- [转载]GO富集分析工具和Pathway富集分析工具
- http://www.omicshare.com/forum/thread-826-1-2.html http://www.omicshare.com/forum/thread-955-1-1.html 今天在omicshare平台上发现了两个很好的在线工具，也有教程，转载一下。 一、GO富集介绍： Gene Ontology（简称GO）是一个国际标准化的基因功能分类体系，提供了一套动 ...
