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  • University of South Carolina Columbia,Research Associate

    • 生命科学->微生物学->病毒学

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R主成分分析(Principal Component Analysis, PCA) 2016-03-10
主成分分析是一种统计方法, 人们在研究多变量的课题时,变量个数太多就会增加课题的复杂性。人们自然希望变量个数较少而得到的信息较多。主成分分析是对于原 ...
(7956)次阅读|(0)个评论
如何使用R来绘制韦恩图(Venn Diagram) 2016-02-19
下面举例说明如何利用 VennDiagram 软件包来绘制高质量用于发表的韦恩图。   ## 加载 VennDiagram 软件包 > library (VennDiagram) ...
(42247)次阅读|(2)个评论
R 绘图-颜色运用 2016-01-28
R 语言具有较强的科学统计和绘图的功能。说到科研绘图,对颜色地把握至关重要要。好的颜色搭配可以绘制出赏心悦目的实验图片。 R 中内置了 657 中颜色。 ...
(7845)次阅读|(0)个评论
ChIP-seq 数据分析 2016-01-19
利用R/Bioconductor 软件包“chipseq” 和“Gviz”对蛋白的结合位点进行分析和显示。 # loading ‘chipseq‘and ‘Gviz‘ > library(chipseq) > l ...
(3866)次阅读|(3)个评论
利用R/Bioconductor分析结肠癌细胞系差异表达基因 2016-01-17
利用 R/Bioconductor 进行基因差异表达分析。首先从 NCBI 下载 GSE46549 数据( GSE46549 中包含了 6 中不同的结肠癌细胞系, HCT116, HT-29,RKO, ...
(4703)次阅读|(0)个评论
Pubmed数据库中检索含有指定关键词文章的数量 2016-01-15
Pubmed库中检索含有指定关键词文章的数量—预测CRISPR哪年获诺奖 研究人员在作报告时,会经常要统计相关领域发表文章的数量。这个可以用 ”RISmed” 软件包 ...
(5030)次阅读|(2)个评论
如何获取所有基因的转录起始位点 2016-01-07
我们在做人类全基因组分析的时候,经常需要找出基因组中所有基因的转录起始位点( Transcription Start Site, TSS ),利用 R/Bioconductor 很容易做到。 ...
(10814)次阅读|(0)个评论

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