科学网

 找回密码
  注册
搜索
热搜: 科学 论文
搜索
BUSCO 运行步骤
卢锐 2021-9-5 11:56
Genome assembly assessment first identifies candidate regions to be assessed with tBLASTn searches using BUSCO consensus sequences. Gene structures are then predicted using Augustus with BUSCO block profiles. These predicted genes, or all genes from an annotated gene set or transcriptome, are then ...
个人分类: Genome|863 次阅读|没有评论
MUMmer4的安装与使用
卢锐 2019-4-22 19:49
在目前的文章中,基因组共线性分析dotplot图几乎全部是用MUMmer或者LAST做的。相比对LAST,MUMmer生成的图似乎更加美观,特别是当fasta id比较长时,last-plot会省略一些id,而mummerplot会全部写出来。但是老实,说我一直用的LAST做共线性,因为MUMmer真心不好安装,坑太多了。不过今天花了大半天时间终于安装成功,记录 ...
个人分类: Genome|11032 次阅读|2 个评论

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2021-11-30 03:08

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部