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采用Stacks2分析RADseq数据[无参]
卢锐 2018-7-29 17:24
Stacks2 的安装： Stacks 目前最新版是 2.1 版。在安装前需用以下命令确认一下电脑上的 gcc 版本，因为 Stacks2.1 需要 gcc 4.9.0 及以上编译器。 gcc --version 如果 gcc 版本过低时可用以下方式升级： 参见 http://ftp.gnu.org/gnu/gcc/ ，可以找到想要下载的 gcc 压缩包，以 g ...
个人分类: Reseq|11348 次阅读|没有评论
Speedseq的安装和使用
热度 1 卢锐 2017-10-30 22:01
题外音： speedseq 是一套流程，套用了大量三方软件，但是居然也能发到 Nature Methods 上！惊讶之余查看了一下代码，非常佩服，简直是教科书一样的模式，太赞了！ 1. speedseq 的安装 1.1 安装前先需安装好 python （建议升级到 2.7 最新版 2.7.13 ），而且需要安装 pysam 库 ( 需 ...
个人分类: Reseq|12901 次阅读|2 个评论 热度 1

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GMT+8, 2024-4-25 15:43

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