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采用Stacks2分析RADseq数据[无参]
卢锐 2018-7-29 17:24
Stacks2 的安装: Stacks 目前最新版是 2.1 版。在安装前需用以下命令确认一下电脑上的 gcc 版本,因为 Stacks2.1 需要 gcc 4.9.0 及以上编译器。 gcc --version 如果 gcc 版本过低时可用以下方式升级: 参见 http://ftp.gnu.org/gnu/gcc/ ,可以找到想要下载的 gcc 压缩包,以 g ...
个人分类: Reseq|6822 次阅读|没有评论
Speedseq的安装和使用
热度 1 卢锐 2017-10-30 22:01
题外音: speedseq 是一套流程,套用了大量三方软件,但是居然也能发到 Nature Methods 上!惊讶之余查看了一下代码,非常佩服,简直是教科书一样的模式,太赞了! 1. speedseq 的安装 1.1 安装前先需安装好 python (建议升级到 2.7 最新版 2.7.13 ),而且需要安装 pysam 库 ( 需 ...
个人分类: Reseq|10562 次阅读|2 个评论 热度 1

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GMT+8, 2021-10-21 22:45

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