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abinit编译过程中的一些坑
李云海 2021-10-23 18:04
abinit是和QE并列的两大开源第一性原理软件。若论历史比QE还要悠久(abinit: 1997, QE: 2002),赝势库和功能也很全面,但安装和使用都非常复杂,导致一致不温不火。我刚上研究生时就学过这个软件,但被天书一般的输入文件折磨得头大不已,最后转去学了QE。最近因为工作需要,又把这个软件编译了一次。中间不少波折,在这里 ...
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Audacity内录教程
李云海 2021-5-5 18:08
友情提示: 录音仅供个人学习使用,传播可能构成侵权! 若构成侵权,一切后果由录音和传播者承担,与本文作者无关! 在某些场合下,我们需要录制来自声卡的声音。用免费开源的Audacity可以很方便地完成这个任务。 Audacity下载地址为: https://www.fosshub.com/Audacity.html ,选Windows installer或W ...
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分享一个管理环境变量的程序
李云海 2021-1-16 17:05
科学网博客对Markdown支持实在差,请移步: https://github.com/yhli1016/misc/tree/master/bmod https://gitee.com/yhli/misc/tree/master/bmod
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分享一个无耻的抢资源脚本
李云海 2019-5-10 21:47
计算资源总归是比较稀缺的。集群上一般都有任务管理系统,每个用户按照先来后到排队,公平公正。而由很多人共享的单个服务器就比较糟糕了,得一直地拿top命令盯着进程表,一旦有空余资源立刻提交,手速慢了煮熟的鸭子就要飞掉。有时为了抢资源还得熬夜,还可能闹得组里人际关系紧张。如果能让服务器替我们盯梢,人就可以放 ...
个人分类: 计算机软件|4133 次阅读|没有评论
分享一个算平均电势和面内积分电荷密度的程序
热度 2 李云海 2019-5-7 11:08
下载源码后解压,直接编译即可。 运行时需要输入这个几个参数: 第一个是包含电荷密度或者静电势原始数据的文件名称。第二个是输出文件名称。第三个是针对原始数据的缩放因子,因为cube格式使用原子单位制,需要转换为国际单位制(立方埃或eV)则指定该因子,不需转换时则设置为1。最后一个是积分算法,1为梯形法 ...
个人分类: 计算机软件|6377 次阅读|3 个评论 热度 2
巧用宏处理器生成输入文件
热度 3 李云海 2019-5-3 11:38
情景分析 在研究中,经常需要对一系列体系执行相同的计算任务。常见的例子比如考察不同外场对某种性质的影响,或者计算同一反应在不同衬底上的能垒。因为同一批次计算任务的输入文件大同小异,有人就偷懒会直接复制上一次的输入文件,最多略作修改。但要准确无误地记住修改哪些参数,并在繁杂的输入文件中找到这些参数 ...
个人分类: 计算机软件|3119 次阅读|3 个评论 热度 3
点评常见的SSH客户端
热度 1 李云海 2019-3-13 15:56
在上一篇博文中忘记写了,在这里补充一下。 PuTTY应该是很多人接触的第一个SSH客户端,师兄师姐推荐的往往就是它。这个软件免费,轻巧,可以拿来应急。但缺点也是非常明显的:不能保存密码,不支持多标签。所以用一段时间之后,很多人都想换掉它。 SecureCRT可以保存密码,也支持多标签,缺点是要收费,并且界面比 ...
个人分类: 计算机软件|2806 次阅读|1 个评论 热度 1
MobaXterm及OpenSSH配置说明
热度 1 李云海 2019-3-13 15:39
做计算的人,每天都需要借助SSH客户端和服务器打交道。常见的SSH客户端有PuTTY、SmarTTY、SecureCRT、XShell和MobaXterm等。几套软件用下来,个人觉得MobaXterm最好用。MobaXterm其实是安装了OpenSSH和X server的Cygwin,因此可以和虚拟机中的Linux共享一套配置信息。配置信息都是明文文件,不涉及注册表,可以直接复制到 ...
个人分类: 计算机软件|21386 次阅读|1 个评论 热度 1
Pmod使用说明
李云海 2018-12-17 16:11
基本介绍 刚上手第一性原理计算的人,应该都遇到过类似 “-bash: xxx: command not found” 或者 “xxx: error while loading shared libraries: libxxx.so: cannot open shared object file: No such file or directory” 的错误。如果自己编译过 abinit 、 QE 、 siesta 等软件,一般也遇到过已经安装了 ...
个人分类: 计算机软件|7730 次阅读|没有评论

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