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2020年(1): 抗新冠肺炎的药物靶标预测及虚拟筛选网络应用平台D3Targets-2019-nCoV
2020-5-8 21:21
近日,《药学学报》英文刊( Acta Pharmaceutica Sinica B )发表了中科院上海药物研究所开发的基于互联网的抗新冠肺炎( COVID-19 )的药物靶标预测及虚拟筛选平台( D3Targets-2019-nCoV ),该平台既可以为活性化合物预测潜在的作用靶标,也可开展基于多靶标多位点的药物虚拟筛选,以期推动抗 COVID-19 ...
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2019年总结3-上海药物所发展出药物结合口袋的动态特征及相关性分析新方法与应用平台:D3Pockets
2019-12-21 12:29
一、引言 药物分子一般都是通过与靶标蛋白结合而发挥药效的。蛋白质上往往同时存在多个空腔,其中能和小分子结合并发挥调控蛋白质功能的空腔称为可药性口袋。不同于结晶状态,生物体中的蛋白质结构总是不停地运动变化着的。因此,蛋白质上药物结合口袋位置及动态性质等信息对基于结构的药物设计及先导 ...
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2019年总结2-“博爱”的弱相互作用:卤键的本质与特征
热度 1 2019-12-21 08:28
卤键是一种被广泛应用于药物设计和材料科学等多个领域的非共价相互作用。分子内共价结合的卤原子由于其电荷分布的各向异性,其顶端往往会形成一个带正电荷的亲电性区域( σ-hole ),这一区域可与亲核基团相互吸引。 2013 年, IUPAC 将“含卤分子实体中卤原子的亲电区域与同一或另一分子实体中亲核区域的 ...
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2019年总结1-上海药物所徐志建博士及其团队发现晶体结构中非键相互作用被低估现象
2019-12-21 08:16
一、引言 药物分子与靶标蛋白一般都是通过非键相互作用(即非共价作用力:氢键、阳离子 -π 作用、 π-π 作用、离子键、卤键等)而发挥药效的,其中氢键是最常见也最重要的一种结合作用。在药物 - 靶标的晶体结构中,可以直观地看到非键相互作用的分布。中科院上海药物研究所朱维良课题组徐志建 ...
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GMT+8, 2020-6-5 18:20

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