系统生物学的阶段发展，可以划分为几个时期

1968年到1992年之间，“systems biology”没有出现过第2次，国际上争议比较大是期间的生物系统研究是否系统生物学；然而，“synthetic biology”尽管1910年到2000年出现数次，却很明确不是系统方法的合成生物学研究。

20世纪60-80年代：

1968年，D.Mesarovic提出“systems biology”词汇和系统论方法用于生物学研究，之前和之后有“systems ecology”和“system physiology”等发表和R.Rosen发表系统分层次理论和方程。

划分为：1）系统科学理论；2）生物控制论、生物化学系统论和代谢网络理论等理论生物学；3）数学生物学和4）计算生物学等基本分别发展时期。

20世纪80-90年代：

划分为：1）纳米生物学；2）转基因技术和代谢工程；3）化学和组学生物学；4）网络理论和模块细胞生物学等也是分别发展时期；

20世纪90年代-21世纪初：

1992年，从R.Rosen的数学切入图论、拓扑学，曾邦哲提出系统医药学，及1994年系统遗传学和系统生物工程等，1996年-1999年在国际上提倡生物系统论和系统生物工程概念。

1999年，曾邦哲建立第1家系统生物科学与工程（biosystem network）网站，筹备协会和会议并阐述为理论与实验、计算与工程方法的生物系统与人工生物系统研究。

2000年，H.Kitano举办第1届国际系统生物学会议，L.Hood建立第1家系统生物学研究所，E.Kool重新提出“synthetic biology”等。

21世纪初到10年代：

依据1999-2004年的论文，以出发点学科和研究方法，形成系统生物学几大学派。

1）数学生物学 - E.Voit、DB.Kell和O.Wolkenhauer等；

2）计算（In Silico）生物学 - D.Nobel、M.Tomita和H.Kitano等；

3）技术（Nano-fluidics）生物学（Omics）- G.Church、R.Aebersold、T.Ideker和L.Hood等；

4）合成（工程）生物学 - J.Nielsen、E. Kool、J.Collins、van Oudenaarden、AP.Arkin、SA.Benner、D.Endy和T.Knight等；

5）网络生物学 - T.Pawson、S.Leibler、MA.Savageau、B.Palsson和A-L.Barabási等。

系统与合成生物学概念，国际共识，包含理论与实验、计算方法的生物系统和工程方法的人工生物系统等基本叙述；但是，仍然大量分别以学派模式研究和发表论文，交叉学科的整合有待时日。

-（社会观察）-

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