赖江山的博客分享 http://blog.sciencenet.cn/u/laijiangshan 生态、统计与R语言

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“水杉”生态统计讲坛第八讲:样本量不一致时的α与β多样性计算 2023年5月17日 早 9:00-11:00
2023-5-12 22:22
日期:2023年5月17日 早 9:00-11:00 报告人: 邹怡 西交利物浦大学副教授 主持人:赖江山教授 地点:南林新图书馆114会议室 腾讯会议: 194-224-161 样本量不一致时的α与β多样性计算 在进行生态学研究时,不同样本的采集量通常并不一 ...
个人分类: 水杉统计讲坛|1970 次阅读|没有评论
请安装最新版glmm.hp(0.0-9),将lm,glm的R2分解纳入glmm.hp,基本涵盖了整套线性回归
2023-4-13 08:14
glmm.hp包在0.0-7版本之前,glmm.hp函数输入对象为lme4、nlme和glmmTMB包得到的GLMM模型,最近,我又把lm和glm也纳入glmm.hp。之前没有纳入lm和glm是因为rdacca.hp可以做lm的分解,而glm则是有 常用的 hier.part包可以分解。 现在glmm.hp可以直接分解lm和glm了,且比hier.part和rdacca.hp输入对象更简单,直接可以是模 ...
个人分类: glmm|2486 次阅读|没有评论
MEE的文章来的本人文章的引用榜首
热度 1 2023-4-11 10:59
2022年4月发表在英国生态学会期刊Methods in Ecology and Evolution的文章,目前已经来到本人文章的列表引用榜首170次(google学术的数据),超过本人2009年在Journal of vegetation science的发表的文章(169次,此文也是古田山大样地的第一篇SCI论文,目前引用排在JVS当年发表110篇文章的第6名)。2019年的Ecosphere的文 ...
个人分类: 刊物|1476 次阅读|1 个评论 热度 1
“水杉”生态统计讲坛第七讲:标准化主轴回归在植物功能性状中的应用
2023-4-9 07:36
标准化主轴回归在植物功能性状研究中的应用 日期:2023年4月12日 早上9:30-11:00 报告人:陈思翀 中科院 武汉植物园研究员 主持人:赖江山教授 地点:南林生环学院行政楼二楼会议室 腾讯会议:672-427-305 报告内容 异速生长是生物界普遍存在的基 ...
个人分类: 常规统计|2782 次阅读|没有评论
“水杉”生态统计讲坛第六讲:多元统计的应用
2023-3-17 08:08
日期:2023年3月19日19:00-22:00 主持人:赖江山教授 腾讯会议:379-385-613 报告1: 胡文浩 浙江农林大学风景园林学院讲师 从距离开始:如何理解数量生态学的多维度数据分析方法体系? 生态学数据复杂的数据结构与环境条件是制约生态学 ...
个人分类: 常规统计|1725 次阅读|没有评论
请安装更新版glmm.hp(0.0-7),解决一个无关变量带NA导致总R2跟变量R2之和不相等的问题
2023-3-3 14:27
最近有个glmm.hp的用户反馈他获得每个固定效应因子的(fixed effect)的Individual值的和并不等于总的marginal R 2 。 通过我排查后,发现问题是他的原始数据中,有一些没有应用 到模型中的有些列里面具有NA值(红色的地方)引起的。 glmm.hp函数输入对象很非常简单,即lme4包、n ...
个人分类: glmm|1597 次阅读|没有评论
Wiley发来Top cited paper的通知
2023-2-27 22:46
2月21日,W iley 发邮件通知我说2022在 Methods in Ecology and Evolution ( MEE )第4期的论文( Lai et al. 2022a )成为该刊 2021-2022 年的 Top cited paper(图1) 。这个邮件还是其他作者告知我才知道的,因为发给我的 email 被邮件系统自动识别为垃圾邮件,直到2月25日才从垃圾箱捡回来。 我好奇从 Web o ...
个人分类: rdacca.hp|2015 次阅读|没有评论
更新rdacca.hp包到1.0-9版本,升级permu.hp函数,让tibble数据类型也能使用
2023-2-13 14:54
tibble是R语言中一个用来替换data.frame类型的扩展的数据类型,伴随着Hadley的 tidyverse包的流行,tibble类型也越来越普及。之前我写代码没考虑这个类型的数据。这导致如果是tibble类型的解释变量,在permu.hp函数做置换检验过程会出现匹配出错的情况,现在修改了代码,自动将运行过程tibble类型数据转化为data.frame ...
个人分类: rdacca.hp|1519 次阅读|没有评论
glmm.hp包不允许带有scale函数和交互作用项(回答一个加拿大博士生的问题)
2023-2-5 22:28
今天收到加拿大Sherbrooke大学一个博士生的来写咨询为什么模型里面带有scale标准化处理固定效应项目和交互项无法使用glmm.hp包,原文如下: 她咨询的glmm模型是用glmmTMB来处理:Numeric1 ~ Categoric1 + scale(Numeric2) + scale (Numeric3)+ scale (Numeric4)+ Categoric3 + Categoric4 + Categoric3*Categ ...
个人分类: glmm|1676 次阅读|没有评论
rdacca.hp文章引用到了100次(researchgate统计数据)
2023-1-7 17:05
今天早上,researchgate给我发邮件,通知说去年发表在Methods in Ecology and Evolution的文章已经引用100次,其实也是预料之中,还是老话,方法类的文章,虽然过程比较艰苦,但是效果还是很好的,起码是有用的。也有信心2023年此文章能达到300次引用,立下flag,明年初再验证! Jiangshan Lai* , Yi Zou, ...
个人分类: rdacca.hp|1754 次阅读|没有评论

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