如何去掉数据框带某一字符的行的R代码

赖江山 2017-3-30 21:32

#最近处理一份植物名录，其中要将带有“科”和“属”的行去掉，只保留一个种的行，用grep()函数解决 badong=read.csv(巴东2.csv,header=T) head(badong) #去掉科和属，因为最后有一个总的名录可以匹配 a=badong$中文名 n=grep(科,a) #选择带科的行的index m=grep(属,a) #选择带属的行 ...

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从大样地里面随机抽取若干个小样方的程序

赖江山 2017-1-22 13:33

ran.sam.plot=function(data,Gx,Gy,size,bin,Num) {#data里面含有gx,gy这两列 #Gx,Gy分别是整个样地的两个边长 #size是随机抽取的小样方边长的大小， #bin是设计抽样距离 #Num是随机取样的个数 X=seq(0,Gx-size,bin) Y=seq(0,Gy-size,bin) a=sample(X,Num,replace=T) b=sample(Y,Num,replace=T) result=list() ...

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混合效应模型和广义线性模型计算R方的函数sem.model.fits

热度 3 赖江山 2017-1-7 15:38

#广义线性模型 install.pcakages( piecewiseSEM) library(piecewiseSEM) model - glm(vs ~ wt + disp, data=mtcars, family=binomial) summary(model) library(piecewiseSEM) sem.model.fits(model) #查看Marginal就是 #实际等于1-（Residual deviance/Null deviance）， 这个时候并不是真正的R方，是 ...

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如何选择好的距离指数？

热度 1 赖江山 2017-1-3 17:50

在群落生态学中，计算群落取样点之间的相异（距离）系数矩阵是很多多元统计（比如聚类分析）的基础。很多学者创造出很多的具有生态学意义的方法度量群落相异系数，比如二元数据的Jaccard，Sørensen，还有数量数据的Bray-Curtis，欧式距离等等。很多人在做这个分析的时候会产生一种困惑，到底应该选哪种指数？其实每种 ...

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克里格插值函数kriging

赖江山 2016-12-26 14:26

install.packages(pracma) library(pracma) n - 36 x - c(1, 1, -1, -1, runif(n-4, -1, 1)) # add four vertices y - c(1, -1, 1, -1, runif(n-4, -1, 1)) u - cbind(x, y) v - numeric(n) for (i in 1:n) v - f(c(x , y )) kriging(u, v, c(0, 0))   ...

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自动生成加入R方和P值散点回归线图的函数

赖江山 2016-12-18 22:29

plotAnnotatedScatter - function(x, y, pointCol=rgb(0,0,0,0.7), legendPos=topleft, legendCex=1,Xlab=,Ylab=, ... ){ # Generate a linear mo ...

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“基于R语言统计分析方法”的培训在尼泊尔特里布大学开班

热度 2 赖江山 2016-11-21 07:35

为期10天的中国科学院加德满都科教中心R语言培训班开班，中科院副院长谭铁牛院士和特里布文大学常务副校长Tirth Raj Khaniya教授共同参加了开班仪式， 中国科学院加德满都科教中心主任、青藏高原所所长姚檀栋院士为博主颁发培训班讲员聘书。 包括前副校长Chandra Mani Paudel教授在内来自不同系20多位特里布文大学教师参加 ...

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《数量生态学-R语言的应用》（赖江山 译）由高等教育出版社出版

热度 7 赖江山 2014-5-18 20:46

亚马逊购书网页 http://www.amazon.cn/%E6%95%B0%E9%87%8F%E7%94%9F%E6%80%81%E5%AD%A6-R%E8%AF%AD%E8%A8%80%E7%9A%84%E5%BA%94%E7%94%A8-Daniel-Borcard-Fran-ois-Gille/dp/B00K7PWE8O/ref=sr_1_2?ie=UTF8qid=1400416872sr=8-2keywords=%E6%95%B0%E9%87%8F%E7%94%9F%E6%80%81%E5%AD%A6-R%E8%AF%AD%E8%A8%80%E7 ...

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