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晶老师与一位化学同行在茶座里的对话(1) 精选

已有 5319 次阅读 2010-10-20 13:04 |个人分类:未分类|系统分类:观点评述

晶: 化老师,好久不见啦!学院设置的这咖啡茶座真还不错,你有经常来这里喝咖啡吗?

 

化: 没有!是第一次来,我正想问你最近我的学生送的单晶样品是不是能快点安排上机哩!

 

晶: 还没,最近送来的样品越来越多,一阵子松一阵子紧的,但我们会尽快的做出安排的。

 

化: 看来23台衍射仪都不够用啊!不过,我不一定要知道全部的结构,只要知道。。。

 

晶: 大概你还不了解单晶结构分析是“只批发不零售”,要么不出来,要出来就全都出来了。

 

化: 这和谱学分析不一样?我只想了解手性基团是不是带上去了,还有那个拆分是不是成功?

 

晶: 所谓X光结构分析是将单晶作为衍射光栅,首先得到大量衍射点(即进行一次富里埃变换),然后用计算方法模拟光栅(即进行一次反富里埃变换),就得到晶体的微观空间结构。从模拟得到的结构信息不仅是完整的也是权威的,敢这么说得看模拟过程有没犯大的过错。

 

化: 你知道搞化学的知道原子在空间的连接次序就够了,我们对空间群的指定不那么感兴趣。

 

晶: 是的,化学家们和晶体学家在这里有一点接不上茬,但要承认空间群问题马虎不得的。只要说一点你可能就明白,如果心对称的晶体误定为非心对称,模拟的结构数据会很粗糙,甚至会粗结构也解不出来。而粗糙结构在原子的类型和价态,单双键等的判断上容易失误。

 

化:或许你说的有点道理。不过实话实说,只要把粗结构告诉我,你说的那些都不成其为问题!

 

晶:看来我们还没达成共识。我理解你的急需,但要想到测定的结果汇集到数据库的后果。仅在剑桥晶体数据库收录的结构现在已超过50万,粗糙甚至是错误的结果将会造成污染。化学家花了九牛二虎之力合成样品,又成功培养出单晶,急急忙忙推出粗糙结果太可惜了,而向数据库存储那精确可靠的数据,使成为共享的财富,我想这是我们彼此共同的愿望吧。

 

化: 和你这么一聊我倒有点明白啦,也知道这些年来你对空间群修订那么感兴趣的原因了。

 

晶: 空间群的修订是晶体学研究的传统课题,因为对称理论是这门学科的核心。我是看到外国同行发表论文纠正我国名校的晶体结构报告后才对这个课题发生兴趣的,说来是十年前的事了。有意思的是,当时打算对日本人一些报道提出质疑时,我曾被怀疑有种族歧视哩。

 

化: 真的? 你说的我好像还是头一次听到啊,能不能请你再。。。对了,今天俺聊的够久了,下次再继续,咋样?

   

晶: 再来一杯热的如何?这免费的咖啡味道真的好极了。

 

化: 好的!。。。以后见!



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