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如何对增广试验数据进行分析
2017-4-11 10:28
参考文献下载 参考文献下载 莫惠栋. 植物育种中的试验设计:行列增广设计 . 扬州大学学报(农业与生命科学版), 1991, 11(1):71-80. 数据: augmented design data 测试品种:1~17 对照:A~E 表中上面是编号,下面是产量 结果 经过繁琐的计算后,得到三个结果,方差分析、矫正值和LSD 方差分析 矫正 ...
个人分类: 农学统计|4026 次阅读|没有评论
增广试验相对于间比法的优势
2017-4-8 19:38
增广试验: 试验没有重复,测试品种无重复,对照有重复,一个区组包括一部分品种的试验,参试品种和对照随机排列。 间比法: 早期测试品种种,每隔10个或20个加1个或2个对照的试验设计。 增广试验相对于间比法的优势: 1,增广设计是随机的,对照也是随机的,因此不存在系统误差 2,增广设计可以给出品种的显 ...
个人分类: 农学统计|3125 次阅读|没有评论
关于遗传参数评估的培训通知
2017-4-5 09:24
asreml介绍 ASReml是拟合线性混合模型的优秀数据分析软件,由NSW Department of Primary Industries的Arthur Gilmour博士开发,可利用灵活的混合线性模型和广义线性模型来处理大规模的数据,实现大数据高效、快速的分析。ASReml可对数量性状、阈值性状、分类性状、SNP标记等多个性状进行分析,并可实现固定效应、随机效应值 ...
个人分类: 农学统计|2307 次阅读|没有评论
读文献(试验设计):alpha-lattice VS RCBD
热度 1 2017-4-2 16:51
Khan M I, Shah S A A, Khan M, et al. Comparative Efficiency Of Alpha Lattice Design And Complete Randomized Block Design In Wheat, Maize And Potato Field Trials . 2015, 11:115-117. 摘要 2011~2014 3年试验,完全随机区组(RCBD)和alpha-lattice试验,应用于小麦、玉米和土豆。 试验效率比较的指标: 误 ...
个人分类: 文献解析|5435 次阅读|2 个评论 热度 1
读书笔记:水产生长性状的遗传相关
2017-3-29 09:47
王照旗, 韩学凯, 白志毅,等. 三角帆蚌紫色选育系1龄阶段内壳色及生长性状的遗传参数估计 . 水产学报, 2014, 38(5):644-650. 摘要 采用群体选育辅助种内群体间杂交选育的方法,以内壳色、体质量作为选育性状,经过连续4代的选育获得了紫色选育系f4。本实验以f4为亲本进行繁殖,利用6对微卫星标记,对15个同批繁育的f4母 ...
个人分类: 文献解析|3147 次阅读|没有评论
读文献笔记:奶牛遗传力、表型相关和遗传相关
2017-3-29 09:41
毛杰, 王根林, 余盼,等. 上海地区荷斯坦奶牛体型性状、产奶性状和体细胞评分的遗传统计分析 . 南京农业大学学报, 2015, 38(4):650-655. 摘要 探究荷斯坦奶牛体型性状(前乳房、后乳房、体躯容量、尻部、肢蹄、乳用特征、泌乳系统和体型总分)、产奶性状(产奶量、乳脂率、乳蛋白率、乳脂蛋比和高峰产奶量)和体 ...
个人分类: 文献解析|5246 次阅读|没有评论
欧洲土壤学报:重复测量数据的分析服务案例
2017-3-24 08:49
欧洲土壤学报是土壤领域中比较知名的杂志,同时这个杂志也以统计方法审核严格著称。 案例 近期,我们帮客户提供了一个土壤方便的数据分析服务,主要分析的数据类型是重复测量数据,即不同处理时期(time)的观测值数据,分为对照和处理两个水平。 客户最初的分析方法 1,方差分析 2,裂区试验 编辑的意见 1,数据 ...
个人分类: 农学统计|3315 次阅读|没有评论
如何在科学网上使用markdown语法写博客
热度 2 2017-3-12 14:24
关于markdown markdown是一种写作语法,具体介绍参考: http://wowubuntu.com/markdown/ 关于markdown编辑器 编辑器有很多,这里推荐有道云笔记,它现在有markdown的窗口,左边编辑,右边显示编辑后的结果。 关于上传图片 有道云笔记的markdown可以用本地图片,但是更推荐使用带有网址的图片,这样一次编辑,一直有效, ...
个人分类: 便捷操作|4454 次阅读|5 个评论 热度 2
用Jupyter学习R语言的第一步:安装
2017-3-11 18:00
R语言简介 R语言是一门统计语言,开源免费,让收费软件节节败退。 RStudio简介 因为R语言的操作界面不怎么友好,RStudio在R中流行起来,它可以将代码、结果、历史、图表一起展示。不用不知道,一用忘不了。它还有rmarkdown,Shiny 有人甚至是先知道RStudio的。。。 Jupyter简介 它以前叫Python notebook, ...
个人分类: 农学统计|10868 次阅读|没有评论
关于SNP在染色体上的分布图怎么做
2017-3-10 08:58
经典图 当然这个图,代码比较复杂,今天来看另一个图 染色体图 这个图的数据是三列,snp | chr | Location,数据很简单,但是如果我没有发现这个包,那么实现的过程很麻烦。 OK,上代码 install.packages(synbreed) library(synbreed) library(synbreedData) data(maize) map - maize$map ## look the for ...
个人分类: 便捷操作|10946 次阅读|没有评论

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