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R语言如何绘制小提琴图violin plot: 邓飞 2019-7-23 22:13; 1. 安装vioplot软件包 install.packages(vioplot) 2. 测试数据生成一段随机数的数据框 dat = data.frame(y = rnorm(1000)) 绘制小提琴图 library(vioplot) vioplot(dat$y) 关注我公众号：育种数据分析之放飞自我 ID： R-breeding; 个人分类: R语言|12882 次阅读|没有评论

R 语言中的汇总统计：如何批量计算不同因素不同水平的平均值: 邓飞 2019-7-16 07:40; 参考 https://stackoverflow.com/questions/12478943/how-to-group-data-table-by-multiple-columns 实际工作中，我们需要对数据进行平均值计算，这里我比较了 aggregate 和 data.table 的方法，测试主要包括： 1，对数据yield计算平均值 2，计算N不同水平的平均值 3，计算N和P不同水平的平均值 1. 常规方法a ...; 个人分类: R语言|4595 次阅读|没有评论

R语言与独孤九剑: 邓飞 2019-2-27 20:42; 三问Python哪里比R好? 为什么要这么做呢, R语言不是很好么, 为什么要换语言呢? 如果实现的功能可以用R语言实现, 为什么要替换为Python呢? R语言学好了么, 完全掌握了么? 为什么要换呢? 这不是给自己找麻烦么? 为什么R比Python好? R语言非常博大精深, 里面有很多专业的包, 有各种各样的算法, 处理数据, 清洗 ...; 个人分类: R语言|2400 次阅读|没有评论

shiny学习笔记3--利用rmarkdown生成html报告: 邓飞 2019-2-18 20:24; 第一个博文讲了如何构建shiny app, 如何上传数据. 第二个博文讲了如何利用shiny app, 下载数据. 这里我们利用下载报表, 使用的是rmarkdown格式. 功能很强大. 流程 1, 生成数据代码: ID = 1:20 y = rnorm(20) dat = data.frame(ID,y) 2, 生成一个rmarkdown文件, head, summary, plot, 以及内容. 3, 下载报表 sh ...; 个人分类: R语言|5184 次阅读|没有评论

shiny学习笔记2-下载数据: 邓飞 2019-1-20 13:20; 上一篇, 介绍了shiny app的创建, 包括如何上传数据, 查看数据及汇总数据. 这里我们介绍如何下载数据. 流程 1, 生成20个随机数, 编号为1:20 2, 下载为csv格式生成数据代码: ID=1:20 y=rnorm(20) dat=data.frame(ID,y) shiny代码 library(shiny) library(data.table) ...; 个人分类: R语言|2220 次阅读|没有评论

shiny学习笔记1---上传数据: 邓飞 2019-1-16 19:25; Shiny简介 Shiny是RStudio公司开发的新包，有了它，可以用R语言轻松开发交互式web应用。 Shiny特性只用几行代码就可以构建有用的web应用程序—不需要用JavaScript。 Shiny应用程序会自动刷新计算结果，这与电子表格实时计算的效果类似。当用户修改输入时，输出值自动更新，而不需要在浏览器中手动刷新。 Shin ...; 个人分类: R语言|3632 次阅读|没有评论

R语言数据和统计结果怎么更友好显示并输出到word: 热度 1 邓飞 2018-10-24 20:00; 1. 软件包介绍: xtable和flextable 这个软件包，主要是可以将R的对象生产Latex和html的格式，但是对于输出word和直接在R中显示支持不够. 这样就用到到了第二个软件包: flextable. flextable有很多功能, 比较好用的是它可以将xtable的格式转化为flextable, 这样就可以进行图表的可视化和结果输出, 它可以输出word和PPT格 ...; 个人分类: R语言|7608 次阅读|2 个评论热度 1

聚类分析---R语言: 邓飞 2018-8-8 20:42; 1，原始数据，是矩阵，有行头和列名： 2，amap包的聚类分析： library(amap) clu - hclusterpar(matx) plot(clu,sub=,hang = -1,xlab = NA,ylab = NA,main = NA) 用法： hcluster(x, method = “euclidean”, diag = FALSE, upper = FALSE, link = “complete”, memb ...; 个人分类: R语言|3478 次阅读|没有评论

如何利用RStudio开发R包，并使用git同步到github中（How to）: 邓飞 2018-7-29 13:02; 如何利用RStudio开发R包，并使用git同步到github中（How to）作者按：之前有过笔记，这次重新整理一下。只有以分享为目的的笔记，才会写的系统一点。之前的笔记，大半是自言自语，过一段时间，就忘记了当时的语境，也分不清自己到底说了什么。写作是锻炼思维的，一个人只有写的清楚，才能够想清楚，否则只是一时感悟 ...; 个人分类: R语言|5763 次阅读|没有评论

我重新下载了R语言，我首先要安装的软件包: 邓飞 2018-6-27 20:39; 经常用到的包： 1，tidyverse tidyverse. 是一个经常使用包的集合，包含 ggplot2(数据可视化), dplyr（数据处理）, tidyr（数据清洗）, readr（数据导入）等，具体可见： 2，data.table 读取数据比较快，fread函数比较智能，能够自动识别分隔符和有无表头 3，shiny 可以构建可视化的交互界面 ...; 个人分类: R语言|5344 次阅读|没有评论

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