科学网

 找回密码
  注册
如何利用R中的agricolae包进行增广试验设计,并生成田间种植图
邓飞 2016-12-12 15:44
That’s a great time!!! 试验描述 120个品种,共种15个区组,每个区组有两个重复。 library(agricolae)ck-c(先玉335,郑单958)entry-paste(16N,001:120,sep = )head(entry) design.dau 函数介绍 然后生成试验设计,design.dau函数,有3个参数,第一个是对照,第二个是品种,第 ...
个人分类: 农学统计|6205 次阅读|1 个评论
育种值、配合力、BLUP、GBLUP这些统计方法你get到了多少?---培训
邓飞 2016-11-14 16:41
培训通知具体见附件: R与ASReml-R统计分析培训会通知11.26-27.pdf 软件介绍: ASReml是拟合线性混合模型的优秀数据分析软件,由NSW Department of Primary Industries的Arthur Gilmour博士开发,可利用灵活的混合线性模型和广义线性模型来处理大规模的数据,实现大数据高效、快速的分析。ASReml可对数量性状、阈 ...
个人分类: 农学统计|11763 次阅读|没有评论
用ASReml分析一年多点数据,并检测地点间异质性
邓飞 2016-11-5 09:01
数据: wang9.1.csv dat - read.table(wang9.1.csv,head=T,sep=,) str(dat) # 可以看出cul为数字型,需要转化为factor # str(dat) # 'data.frame': 360 obs. of 4 variables: # $ loc : Factor w/ 10 levels L1,L10,L2,..: 1 1 1 1 3 ...
个人分类: 农学统计|2800 次阅读|没有评论
林木育种中数据分析的方法介绍
邓飞 2016-10-8 11:24
林木育种中数据分析的方法介绍 想要参加相关学习和培训,想要得到相关资料和代码,添加微信 joinVSNC 为好友,拉您进入数据分析交流群。 林木遗传改良的目标 利用遗传改良的原理以最低的成本获取单位时间内最大的遗传增益。其中一个重要的环节是估算亲本的遗传参数,包括主要经济性状的遗传力、遗传相关和 ...
个人分类: 农学统计|3162 次阅读|没有评论
农业鉴定数据自动化处理流程
邓飞 2016-10-8 10:49
想要参加相关学习和培训,想要得到相关资料和代码,添加微信joinVSNC为好友,拉您进入数据分析交流群。 现代农业鉴定数据的特点: 1、 规模大,随着育种规模的增加,测试品种的数目越来越大(大于 1,000 个),地点越来越多(大于 10 个) 2、 不同阶段试验设计不同,初级阶段测试品种多,但 ...
个人分类: 农学统计|3571 次阅读|没有评论
asreml R语言 数量遗传学 数据分析
邓飞 2016-9-8 14:41
两天培训:2016年9月24~25 ASReml 2016年9.24-25培训内容及时间安排.doc 地点:北京 第一天上午: R 语言介绍 R 语言软件安装、读取数据 R 语言数据清洗及汇总统计 R 语言常用作图介绍 ASReml 简介及应用 A ...
个人分类: 农学统计|7160 次阅读|没有评论
GBLUP 视频推荐
邓飞 2016-8-1 19:37
Genomic Relationships and GBLUP, 想要学习基因组选择及GBLUP的学霸,这边看过来!北卡罗莱纳州立大学的Fikret Isik 教授主讲,语速很慢哦,完全听得懂! 视频连接地址: http://v.youku.com/v_show/id_XOTU0NjU1Mzcy.html?from=s1.8-1-1.2 关注公众号,了解更多信息:
个人分类: 农学统计|2539 次阅读|没有评论
玉米鉴定数据的批量处理
邓飞 2016-8-1 19:18
对于田间试验和农业数据分析,请加入下面QQ群:VSNC GenStat 交流群 203276907 快速加入群,可以点击这个链接,里面有大量的资料可以下载和交流:点击链接加入群【VSNC GenStat 交流群】: https://jq.qq.com/?_wv=1027k=42XYzLq 玉米鉴定数据批量处理方法介绍 在玉米鉴定 ...
个人分类: 农学统计|2694 次阅读|没有评论
应用根系表型和分子标记鉴定不同磷处理影响油菜根系发育的遗传位
邓飞 2016-7-31 18:12
应用根系表型和分子标记鉴定不同磷处理影响油菜根系发育的遗传位点 High-throughput root phenotyping screensidentify genetic loci associated with root architectural traits in Brassicanapus under contrasting phosphate availabilities 物种:油菜 期刊: Annals of Botany 影响因子: 3.65 ...
个人分类: 农学统计|2622 次阅读|没有评论
怎么用R语言做GGE Biplot双标图(how to)(代码分享及结果解读
热度 1 邓飞 2016-7-31 18:05
怎么用 R 语言做 GGE Biplot 双标图( how to ) 主要结论: 基本可以做出 GGE Biplot 双标图,颜色有点丑。 在数据没有缺失值的情况下,可以分析,但是如果有缺失值,就不能分析,对数据格式要求较为严格。 如果数据中有缺失值,建议用 GenStat 分析。 下面的例子说明 R 语言和 GenStat 针对同样的数 ...
个人分类: 农学统计|12511 次阅读|1 个评论 热度 1

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2024-3-29 15:22

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部