不平衡数据的显著性检验方法以及多重比较（How to）

热度 1 邓飞 2017-4-17 12:10

本节主要论述当数据存在缺失值或者不平衡数据时，如果进行显著性检验，进行多重比较，以及估算效应值。 主要用到的方法有ANOVA，unbalance ANOVA， Mixed model 数据下载 missing data.csv 本数据是二因素随机区组，N和S为两个因素，N有3个水平，S有4个水平，有3个区组。 数据缺 ...

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如何对增广试验数据进行分析

邓飞 2017-4-11 10:28

参考文献下载 参考文献下载 莫惠栋. 植物育种中的试验设计:行列增广设计 . 扬州大学学报(农业与生命科学版), 1991, 11(1):71-80. 数据： augmented design data 测试品种：1~17 对照：A~E 表中上面是编号，下面是产量 结果 经过繁琐的计算后，得到三个结果，方差分析、矫正值和LSD 方差分析 矫正 ...

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增广试验相对于间比法的优势

邓飞 2017-4-8 19:38

增广试验： 试验没有重复，测试品种无重复，对照有重复，一个区组包括一部分品种的试验，参试品种和对照随机排列。 间比法： 早期测试品种种，每隔10个或20个加1个或2个对照的试验设计。 增广试验相对于间比法的优势： 1，增广设计是随机的，对照也是随机的，因此不存在系统误差 2，增广设计可以给出品种的显 ...

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关于遗传参数评估的培训通知

邓飞 2017-4-5 09:24

asreml介绍 ASReml是拟合线性混合模型的优秀数据分析软件，由NSW Department of Primary Industries的Arthur Gilmour博士开发，可利用灵活的混合线性模型和广义线性模型来处理大规模的数据，实现大数据高效、快速的分析。ASReml可对数量性状、阈值性状、分类性状、SNP标记等多个性状进行分析，并可实现固定效应、随机效应值 ...

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欧洲土壤学报：重复测量数据的分析服务案例

邓飞 2017-3-24 08:49

欧洲土壤学报是土壤领域中比较知名的杂志，同时这个杂志也以统计方法审核严格著称。 案例 近期，我们帮客户提供了一个土壤方便的数据分析服务，主要分析的数据类型是重复测量数据，即不同处理时期（time）的观测值数据，分为对照和处理两个水平。 客户最初的分析方法 1，方差分析 2，裂区试验 编辑的意见 1，数据 ...

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用Jupyter学习R语言的第一步：安装

邓飞 2017-3-11 18:00

R语言简介 R语言是一门统计语言，开源免费，让收费软件节节败退。 RStudio简介 因为Ｒ语言的操作界面不怎么友好，RStudio在R中流行起来，它可以将代码、结果、历史、图表一起展示。不用不知道，一用忘不了。它还有rmarkdown，Shiny 有人甚至是先知道RStudio的。。。 Jupyter简介 它以前叫Python notebook， ...

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R语言 对系谱信息的图形化展示

邓飞 2016-12-27 17:06

代码如下： # example with 9 individuals library(synbreed) #如果没有synbreed包，需要安装 #install.packages(synbreed) id - 1:8 par1 - c(0,0,0,1,2,3,1,2) par2 - c(0,0,0,2,0,0,0,0) gener - c(0,0,0,1,1,1,1,1) # create pedigree object ped - create.ped ...

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重复测量数据的分析方法（裂区试验、调和GG法、混合线性模型）

邓飞 2016-12-26 14:18

重复测量数据的分析方法 这里主要介绍了重复测量数据的分析方法，分别是： 一般线性模型： 方差分析：这里采用了裂区试验的分析方法 矫正方差分析：通过Greeenhouse-Geisser法对裂区方差分析的F值进行矫正 多元分析：条件不满足时可以通过多元分析的方法进行分析 混合线性模型： 协方差结构：Uniform correlation 协方 ...

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增广试验设计（augmented design）分析流程（R、GenStat、SAS）

邓飞 2016-12-15 19:54

数据：这三个数据内容是一致的。 data.txt data.gsh data.xlsx 参考资料： SASprogramAugDes.pdf R代码： 用R语言包进行增广设计数据分析.R R语言生成的结果： R语言处理的结果.csv R语言分析的结果主要是根据一般线性模型，其实质是对方差分析的进一步调整，所谓的调和均值，其实就是混线性 ...

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