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玉米鉴定数据的批量处理
邓飞 2016-8-1 19:18
对于田间试验和农业数据分析,请加入下面QQ群:VSNC GenStat 交流群 203276907 快速加入群,可以点击这个链接,里面有大量的资料可以下载和交流:点击链接加入群【VSNC GenStat 交流群】: https://jq.qq.com/?_wv=1027k=42XYzLq 玉米鉴定数据批量处理方法介绍 在玉米鉴定 ...
个人分类: 农学统计|1884 次阅读|没有评论
应用根系表型和分子标记鉴定不同磷处理影响油菜根系发育的遗传位
邓飞 2016-7-31 18:12
应用根系表型和分子标记鉴定不同磷处理影响油菜根系发育的遗传位点 High-throughput root phenotyping screensidentify genetic loci associated with root architectural traits in Brassicanapus under contrasting phosphate availabilities 物种:油菜 期刊: Annals of Botany 影响因子: 3.65 ...
个人分类: 农学统计|1802 次阅读|没有评论
怎么用R语言做GGE Biplot双标图(how to)(代码分享及结果解读
热度 1 邓飞 2016-7-31 18:05
怎么用 R 语言做 GGE Biplot 双标图( how to ) 主要结论: 基本可以做出 GGE Biplot 双标图,颜色有点丑。 在数据没有缺失值的情况下,可以分析,但是如果有缺失值,就不能分析,对数据格式要求较为严格。 如果数据中有缺失值,建议用 GenStat 分析。 下面的例子说明 R 语言和 GenStat 针对同样的数 ...
个人分类: 农学统计|8731 次阅读|1 个评论 热度 1
表型相关与遗传相关及其显著性检验(数据及代码分享)
邓飞 2016-7-31 17:13
2018-10-09 修改备注: 1, 将代码修改, AAfun包不太好装, 使用VSNR包 2, VSNR包中有model.comp和asreml.lrt两个函数, 可以进行模型的比较和LRT检验 3, 代码correlation.R correlation.R 附件重新上传. 4, 贴上了我的最新的微信公众号 表型相关与遗传相关及其显著性检验 ...
个人分类: 农学统计|6073 次阅读|没有评论
R语言汇总统计,包括分组数据的汇总,结果友好(代码分享)
邓飞 2016-7-5 09:00
这个包不是必须,如果没有这个包,感兴趣的人可以下载数据来演示: oats.csv library(asreml) library(reshape) library(pastecs) data(oats) head(oats) 第一种,通用的描述性统计一般是没有分组的变量,比如产量,胸径等 stat.desc(oats$yield,norm=T) 第二种,手动定义函数,然后可以分组 ...
个人分类: 农学统计|9125 次阅读|没有评论
ASReml-R多性状分析,怎么设置初始值?
邓飞 2016-6-23 18:22
建立了一个数据分析500人群,感兴趣的老师、同学 添加微信号: joinVSNC 为好友,拉你进入数据分析群 先进行单变量分析的原因: 1、确定显著性的因素(固定因素、随机因素),剔除不显著的 2、确定方差组分,为多变量分析时提供拟合初始值。 设置初始值的目的: 1、容易拟合 2、快速拟合 具体代码如下 ...
个人分类: 农学统计|1906 次阅读|没有评论
SAS 处理裂区试验代码
邓飞 2016-6-19 22:25
建立了一个数据分析500人群,感兴趣的老师、同学 添加微信号: joinVSNC 为好友,拉你进入数据分析群 这里的数据是GenStat里面的Oats.ghs data split; input block$ w$ s$ v$ n$ y; cards; 1 1 1 Marvellous 0.6cwt 156 1 1 2 Marvellous 0.4cwt 118 1 1 3 Marvellous 0.2cwt 140 1 1 4 Marvellous 0cwt ...
个人分类: 农学统计|1432 次阅读|没有评论
不同试验设计广义遗传率的分析
邓飞 2016-6-19 22:06
附件是不同试验设计广义遗传率分析的具体方法,包括随机区组、一年多点、多年多点怎么估算遗传率。 有问题的可以给我留言,或者发送邮件到Dave@vsni.co.uk。 农业试验中遗传率的计算方法.pdf
个人分类: 农学统计|1803 次阅读|没有评论
excel 计算哈温平衡的卡方和相应的p值
邓飞 2016-4-12 18:01
对于田间试验和农业数据分析,请加入下面QQ群:VSNC GenStat 交流群 203276907 快速加入群,可以点击这个链接,里面有大量的资料可以下载和交流:点击链接加入群【VSNC GenStat 交流群】: https://jq.qq.com/?_wv=1027k=42XYzLq 用excel函数计算 1、先算出p值 2、根据p值和自由度,计算卡方值 ...
个人分类: 农学统计|4111 次阅读|没有评论
联合方差分析的误差方差齐次性检测 R语言程序
邓飞 2016-3-14 13:05
对于田间试验和农业数据分析,请加入下面QQ群:VSNC GenStat 交流群 203276907 快速加入群,可以点击这个链接,里面有大量的资料可以下载和交流:点击链接加入群【VSNC GenStat 交流群】: https://jq.qq.com/?_wv=1027k=42XYzLq 联合方差分析,是用方差分析的方法。首先要考虑各地点见的误差同质性。 ...
个人分类: 农学统计|2783 次阅读|没有评论

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