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用矩阵的方法计算回归分析参数
邓飞 2017-12-23 18:05
1.1 数据来源:来源R语言默认的数据集women 这是一个描述女性身高和体重的数据,我们以height为X变量(自变量),以weight为Y变量(因变量),进行模型的计算。 计算方法参考: https://stats.idre.ucla.edu/r/library/r-library-matrices-and-matrix-computations-in-r/ 1.2 查看数据 data(women) head(wo ...
个人分类: 农学统计|3638 次阅读|没有评论
如何用logistic回归曲线拟合日照和生物量积累的模型
邓飞 2017-12-22 17:18
数据 SPSS错误的做法 很遗憾,spss对于logistic默认的方法不是我们想要的! 错误的做法步骤: 1,打开模型,回归-→ 曲线回归 —-→ logistic 2,查看结果 这里y变量变成了 ln(1/生物量), 系数为:0.999,常量为:0.013,标准化的系数0.397. 很显然,怎么转换不能够和我们熟悉的logistic回归曲线联系 ...
个人分类: 农学统计|5413 次阅读|没有评论
一年多点品种的回归系数和相关系数
邓飞 2017-12-11 20:09
数据 one-year-loc.xlsx GenStat结果:F-W回归分析 回归系数的计算方法 这里 y值是品种在三个地点的观测值 x值是地点所有品种的平均值 这里以dai15为例,解释一下计算方法,整理数据:Y值 X值: ...
个人分类: 农学统计|2009 次阅读|没有评论
G矩阵的计算方法(R语言实现)
邓飞 2017-11-23 11:31
参考文献:http://articles.extension.org/pages/68019/genomic-relationships-and-gblup 生成模拟的基因型原始数据 snp - c(AA Ct GG Ag AA Ct Ga AA tt CC GG AA) ss - strsplit(snp,split = ) snpM - matrix(ss ],3,4,byrow = T) row.names(snpM) - c(ID1,ID2,ID3) ...
个人分类: 农学统计|3823 次阅读|没有评论
Partially replicated (p-rep) designs 文献解析及实现方法
邓飞 2017-8-23 17:58
参考文献 Moehring J, Williams E R, Piepho H P. Efficiency of augmented p-rep designs in multi-environmental trials . Tag.theoretical Applied Genetics.theoretische Und Angewandte Genetik, 2014, 127(5):1049-1060. 摘要 这篇论文介绍了在多环境测试(MET)中效率较高的试验设计方案:部分重复设计( ...
个人分类: 农学统计|1699 次阅读|没有评论
关于MET数据中地点间异质性检验的问题
邓飞 2017-6-27 08:50
绍GenStat、ASReml和R语言处理的方法 介绍GenStat、ASReml和R语言处理的方法 数据:wang9.1.csv wang9.1.csv GenStat 处理方法 ANOVA 对数据进行筛选,选择第一个地点的数据,进行分析,得到第一个地点的MSE。 第一个地点的自由度和MSE 10个地点的DF和MSE: Bartlett’s test GenStat command: VHOMOGENEITY ...
个人分类: 农学统计|2017 次阅读|没有评论

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