科学网—yijiaobai的博文 - 第10页

设为首页收藏本站

开启辅助访问切换到宽版

科学网 › 我的中心 › 博文 › yijiaobai的博文

yijiaobai

https://blog.sciencenet.cn/?2577109

农学统计| 杂谈| 随感| 翻译博客| 便捷操作| 文献解析| Python和Julia学习| R语言| 数量遗传学| 机器学习| GWAS|

关于联合方差分析的讨论-1 联合方差分析的定义: 邓飞 2016-3-9 14:08; 联合方差分析是一个比较内行的、比较封闭的、也可以说是比较专业的称谓，它主要应用于农业多点试验，用来评价品种的平均表现、对环境变化的反应特点以及其适应区域。它首先是方差分析，但由于它是一年多点的试验，包括品种和环境的互作。问题来了，方差分析的假定是数据正态性、方差齐次性、 ...; 个人分类: 农学统计|6152 次阅读|没有评论

R语言中计算blue和blup值的包：lme4、nlme、MCMCglmm、asreml: 邓飞 2016-1-14 13:39; 数据： tree.rda 利用同一数据，演示不同软件包：lme4、nlme、MCMCglmm和asreml估计BLUE值和BLUP值的代码。固定效应：Block 随机效应：Family 代码： ###############lme4中运行blue和blup的方法############### load(tree.rda) library(lme4) df-lme - lmer(Height~1+Block+(1|Family),data=t ...; 个人分类: 农学统计|22996 次阅读|没有评论

QTL与环境互作文献解读: 邓飞 2016-1-7 10:01; 芜菁在不同干旱处理下考察开花前生理生态性状相关 QTL 与环境的互作 Genotype–environmentinteractions affecting preflowering physiological and morphological traits ofBrassica rapa grown in two watering regimes 物种：芜菁期刊： Journalof Experimental Botany 影响因子： 5.79 发表单位：瓦赫宁根大 ...; 个人分类: 农学统计|4238 次阅读|没有评论

双标图GGE分析在农作物品种多点试验中的应用（综述）: 邓飞 2016-1-7 09:39; 杂志：作物学报发表单位：加拿大农业部加东粮油中心发表时间： 2010 年 8 月双标图经常用于农作物多点试验的数据分析，严威凯老师开发了一个名为 GGE-biplot 的软件，但软件没有相关的使用教程，操作不便， GenStat 软件完全可以实现它的功能。本次文献解读介绍怎么用 GenStat 实现 GGE 双标图。 ...; 个人分类: 农学统计|4816 次阅读|没有评论

SAS、SPSS、R和GenStat分析裂区试验数据代码、模型干货分享: 邓飞 2015-12-30 21:34; SAS、SPSS、R和GenStat在裂区试验数据分析中如何实现结论： 1、四种软件结果再平衡数据（没有缺失值）的情况下是一致的。 2、SAS和R进行多重比较时比较麻烦。 3、SPSS根本就无法对交互作用的因子进行多重比较，而且多重比较的形式乖乖的。 4、GenStat操作最简单，结果最直观。 ps：如果想咨询数据分析的问题，请 ...; 个人分类: 农学统计|7546 次阅读|没有评论

不完全双列杂交NCⅡ设计的数据处理方法: 邓飞 2015-12-28 10:52; 不完全双列杂交 NC Ⅱ设计的数据处理方法在育种过程中，经常需要通过试验设计评价种质资源的遗传特性 , 培育和引进自交系的好坏，不完全双列杂交用于评价种质遗传结构和配合力十分有用。不完全双列杂交是指把供试亲本按试验要求分为两组，只进行组间杂交，不进行组内杂交。在培育品种的过程中，常 ...; 个人分类: 农学统计|9033 次阅读|没有评论

一年多点、一点多年、多年多点的数据分析，计算品种的blup值: 热度 1 邓飞 2015-11-17 20:28; 数据来源： year_location_data.csv 这是一个农作物产量的数据，为多年多点数据，目的是为了计算品种的blup值。分为两个地点：北京和上海两个年份：2009和2010 四个观测值：trait_1-4 数据格式如下：数据分析为品种、重复、年份、地点和四种性状，数据有缺失值，用*号表示，如下所示：用到的软件：GenSta ...; 个人分类: 农学统计|10404 次阅读|1 个评论热度 1

遗传方差成分估计（Estimated variance components）: 邓飞 2015-7-5 12:46; 有时也翻译为方差分量，今天弄明白什么意思了，以一个示例说明：参考孔繁玲编著《植物数量遗传学》第六章，遗传交配设计与遗传方差成分估计，例6.1所示，是评价玉米自交系群体的变异情况，从群体中随机取出8个有代表性的自交系，以4次重复的随机完全区组设计作田间试验考察小区产量，数据如下： kong-fan-ling-varian ...; 个人分类: 农学统计|9412 次阅读|没有评论

用GenStat处理二因素随机区组并做多重比较: 邓飞 2015-7-4 18:39; 二因素随机区组并做多重比较： excel太复杂 SPSS没有区组的概念，而且对于交互作用的多重比较，还要通过编程去做 DPS可以做，但是格式古板，而且缺乏伸展性，国外认可度低看一下专门做农业统计的软件GenStat怎么做。数据：农业上查看氮和硫不同浓度产量的影响，其中N有3个水平，S有4个水平，区组有3个，部 ...; 个人分类: 农学统计|3338 次阅读|没有评论

1 ... 2 3 4 5 6 7 8 910

会议

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2024-4-16 14:56

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部