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总结 | R语言批量读取写入Excel数据
邓飞 2021-6-19 17:21
前一段,写过一篇: R语言中写入Excel的不同sheet表格 ,最近学习了tidyverse的方法,感觉需要总结一下,更新一下知识结构。 本文准备用实际数据,做一下操作: 「批量读取:」 批量读取多个Excel数据 批量读取一个Excel数据的不同表格 「批量写入」 批量写入Excel数据 1,批量写入到不同 ...
个人分类: 农学统计|337 次阅读|没有评论
一文讲清遗传相关
邓飞 2021-6-18 21:37
一些育种的基本概念,需要看教科书理解一下。这次我学习教科书,加深对相关概念的理解,最后用实际数据演示一下如何计算遗传相关及显著性。 「参考书:」 Raphael A.Mrode编著,于向春 张豪 主译《线性模型在动物育种值预测中的应用》 第三版 陈国宏, 张勤. 动物遗传原理与育种方法 . 中国农业出版社, 2009. ...
个人分类: 数量遗传学|402 次阅读|没有评论
tidyverse之汇总统计
邓飞 2021-6-16 22:36
之前写过一篇博客,介绍R语言的 aggregate 函数的汇总统计,最近学习 tidyverse ,感觉更好用,对比学习一下。 1 模拟数据 这里模拟了4个因子,5个观测值的数据框, 主要介绍了一下几种方法的汇总统计: 1, 单变量~单因子,单个个统计量, 这里使用平均数mean 2 单变量~单因子,多个个统计量, 这里使用自定义的函 ...
个人分类: 农学统计|443 次阅读|没有评论
通过代码理解中心化和标准化
邓飞 2021-6-15 22:45
1. R中的方差和标准差 「方差: var ,是样本方差」 ❝ var(y) instructs R to calculate the sample variance of Y. In other words it uses n-1 'degrees of freedom', where n is the number of observations in Y. ❞ 「标准差: sd ,是样本标准差」 ❝ var(y) instr ...
个人分类: 农学统计|465 次阅读|没有评论
亲缘关系推断软件:king
邓飞 2021-6-14 22:00
❝ 今天是端午节,放假了几天,除了分析一个紧急的项目,基本处于放空状态。没有工作,没有动脑。主要内容是遛娃,吃饭,睡觉。下午回来,放空几天的大脑开始回归,想起自己好久没有发文了,介绍一款亲缘关系推断的软件: king ❞ 1. 亲缘关系推断重要性 育种中,判断亲子关系,判断全同胞半 ...
个人分类: 数量遗传学|441 次阅读|没有评论
R语言循环第三境界:purrr包map函数!
邓飞 2021-6-10 21:28
1. 三境界 R语言写循环有 三境界 : 手动for循环 apply系列 purrr泛函式编程 其中,手动for循环我最常用,apply系列半吊子,purrr函数越用越趁手,这里介绍一下purrr编写循环的方法。 2. 泛函式函数 「泛函式定义:」 ❝ 函数的函数称为泛函式,map(x,f)中,map是函数,f也是 ...
个人分类: 农学统计|353 次阅读|没有评论
混合线性模型的可视化
邓飞 2021-6-5 17:29
1. 数据 这里使用 sleepstudy 数据集,看一下免费的R包 lme4 和付费包 asreml 如何处理不同的混合线性模型,以加深对混合线性模型的理解。 「数据描述:」 ❝ 睡眠剥夺研究中受试者每天的平均反应时间。第0天,受试者有正常的睡眠时间。从那天晚上开始,他们每晚只能睡3个小时,依次进行0~9天。观察结 ...
个人分类: 农学统计|587 次阅读|没有评论
混合线性模型的理解 | 学霸和富二代的故事
邓飞 2021-6-5 17:28
富二代和学霸的故事 看一下 lmer 函数拟合混合线性模型的通用函数: 举个例子,在一个课堂上,小学六年级,班里面有30个学生,这些学生有一年级到五年级的学习成绩,现在根据这些数据,预测这些学生六年级的成绩。 「学生分类:」 富二代,富二代家里有钱,幼儿园和小学都有私人教师,个性化补习,起点较高 ...
个人分类: 农学统计|545 次阅读|没有评论
文献下载文献阅读的方法分享 | 我的三板斧
邓飞 2021-6-5 17:27
这几天在新疆培训,沟通起文献下载文献阅读的方法,这里我分享一下我的三板斧。 1. 搜索文献 1.1 百度学术 「推荐指数:」 *** 文献下载,或者关键词查询,可以用 百度学术 :https://xueshu.baidu.com/ 在这里插入图片描述 搜索一篇文献之后,如果有pdf链接,可以直接打开下载: 现在百度学术, ...
个人分类: 杂谈|571 次阅读|没有评论
用最酷的方法学习R语言
邓飞 2021-6-5 17:18
1. 看大神怎么说 前几天去新疆培训,制作了R语言的基础教程,在翻阅资料时,看到了 知乎张敬信 关于R学习的观点,很是赞同。 张敬信老师写了一本书 《R语言编程--基于tidyverse》 ,网址:https://github.com/zhjx19/introR 下面几段是书中的话: ❝ 国内的R语言博客、教材大多数都很落后。初学R语言 ...
个人分类: R语言|577 次阅读|没有评论

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GMT+8, 2021-6-20 07:54

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