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遗传方差成分估计(Estimated variance components)

已有 9433 次阅读 2015-7-5 12:46 |个人分类:农学统计|系统分类:科研笔记

有时也翻译为方差分量,今天弄明白什么意思了,以一个示例说明:

参考孔繁玲编著《植物数量遗传学》第六章,遗传交配设计与遗传方差成分估计,例6.1所示,是评价玉米自交系群体的变异情况,从群体中随机取出8个有代表性的自交系,以4次重复的随机完全区组设计作田间试验考察小区产量,

数据如下:kong-fan-ling-variance-components.xlsx

软件:GenStat

第一种方法:先用方差分析:

模型如下:


结果如下:

根据期望均方估计实测方差成分:

误差方差σ2=MS1

基因型方差σG2=(MS2-MS1)/r

方差估计值得方差(详见课本,可以计算方差组分的标准误)


因为研究的群体是自交系组成,基因型间方差估计了全部遗传方差,故

总遗传方差=(212.56-0.3)/4=53.06

标准误计算为25.05


第二种方法:用Reml法,把自交系和区组当成随机因子,可以估计方差组分,

模型如下:


结果如下:

方差组分中se不同,是因为方差分析中是手动计算的,舍去了小说点后面的一些值。

最终结果是一致的。


这说明,用软件GenStat的Reml法能更好更智能的估计出方差分量,这在动物和植物育种中的意义重大。


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