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ASreml -r 及R语言 内存设置方法

已有 7621 次阅读 2017-6-19 15:02 |个人分类:农学统计|系统分类:科研笔记



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workspace设置
8e6 = 64Mb
8e7 = 640Mb

image

具体设置
设置 | 实际
—-|—-
8e6 | 64 Mb
1.28e8 | 1G
2.5e8 | 2Gb
5e8 | 4Gb
1e9 | 8 Gb
1.5e9 | 12Gb

G矩阵占用内存的计算方法:

个体ID 标记数 8 /(1024*1024) =  Mb



示例代码:


asreml中设置运行内存为8G, 可以指定workspace=8e8进行设定.

library(asreml)
data(oats)
head(oats)
mod <- asreml(yield ~ Blocks, random = ~ Nitrogen*Variety,data=oats)

mod1 <- asreml(yield ~ Blocks, random = ~ Nitrogen*Variety,
               workspace = 8e8,data=oats) # 大约8G内存




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