育种数据分析之放飞自我分享 http://blog.sciencenet.cn/u/yijiaobai 关注:生物统计,数量遗传,混合线性模型,生物信息,R,Perl,Python,GWAS,GS相关方法,文章及代码

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Rstudio连接不上R语言常用解决方案
2023-1-27 12:24
Rstudio链接不上R语言,默认情况下是不应该发生的,既然发生了,肯定是有些条件没有满足,如果将下面几个条件都满足,应该可以解决这个问题。 1. R和Rstudio安装路径为中文 虽然R和Rstudio支持中文,但是如果安装路径中有中文,很可能R语言安装有问题导致Rstudio找不到R语言,或者安装不上很多R 包。 比如路径: D ...
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R语言行筛选的方法--filter
2022-8-8 08:51
之前写过一篇 R语言列筛选的方法--select ,这里介绍一下行筛选的方法。 下面介绍一下R语言中行筛选的方法,主要介绍filter函数 1. 数据 这里,使用asreml分析中的BLUP值为例,相关的模型为: m1=asreml(Phen~G,random=~vm(Progeny,ainv)+&nbs ...
个人分类: R语言|12132 次阅读|没有评论
R语言如何筛选数据框中的列--select
2022-1-20 19:42
大家好,我是飞哥呀。 我们知道,R语言学习,80%的时间都是在清洗数据,而选择合适的数据进行分析和处理也至关重要,如何选择合适的列进行分析,你知道几种方法? 如何优雅高效的选择合适的列,让我们一起来看一下吧。 1. 数据描述 数据来源是我编写的R包 learnasreml 中的 fm 数据集。 r$library(le ...
个人分类: R语言|20430 次阅读|没有评论
R语言相关性分析和相关性分析可视化常用方法汇总
2021-12-28 19:31
本次,介绍一下相关性分析以及相关性分析可视化常用方法。 0. 相关数据 library(learnasreml) library(tidyverse) data(fm) str(fm) dd=fm%%select(-c(1:5)) head(dd) 1. 相关性分析 1.1 R语言默认函数 cor cor(dd) 这里,原始数据中有缺失值,所以有NA, ...
个人分类: R语言|10951 次阅读|没有评论
Rstuido server选择不同的R版本(conda中的不同R版本)
2021-7-5 20:46
自从上一次服务器重装系统之后,总感觉缺少了一些东西,安装R包很多依赖库报错,也可以解决,但总是存在,烦。 一天,一个同事问我说 ggpubr 包安装不成功,我就自己试了一下,真的是……安装不成功。 当你到了我这个年纪( 破罐子破摔 ),你就会知道, 「如果有包安装不上,那就不安装了」 。所以我就用资深数据分析 ...
个人分类: R语言|5851 次阅读|没有评论
用最酷的方法学习R语言
2021-6-5 17:18
1. 看大神怎么说 前几天去新疆培训,制作了R语言的基础教程,在翻阅资料时,看到了 知乎张敬信 关于R学习的观点,很是赞同。 张敬信老师写了一本书 《R语言编程--基于tidyverse》 ,网址:https://github.com/zhjx19/introR 下面几段是书中的话: ❝ 国内的R语言博客、教材大多数都很落后。初学R语言 ...
个人分类: R语言|5178 次阅读|没有评论
R语言中的方差分析汇总
2020-10-21 22:08
方差分析,是统计中的基础分析方法,也是我们在分析数据时经常使用的方法。下面我总结一下R语言如何对常用的方差分析进行操作。 1. 方差分析的假定 上面这个思维导图,也可以看出,方差分析有三大假定:正态,独立和齐次,如果不满足,可以使用 广义线性模型 或者 混合线性模型 ,或者 广义线性混合模型 去分 ...
个人分类: R语言|16267 次阅读|没有评论
R语言tryCatch使用方法:判断Warning和Error
2020-9-22 19:48
1. 出门掉坑里 因为一些情况,需要判断一行命令运行的状态,然后再做出反应,整体来说: 是否出现warning,出现了怎么处理? 是否出现Error,出现了怎么处理? 没有出现怎么处理? R中判断warning和error状态的函数,我没有找到。一个玩 Java 的同事说, try.....catch 多经典的方法,你怎么不用呢? ...
个人分类: R语言|12951 次阅读|没有评论
R语音读取txt报错:UTF-16不支持 或者<ff><fe><63>\'多字节字符串有错
2020-9-14 22:00
1. 问题描述 一个txt文件,使用R中的 data.table 包中的 fread 函数读取时,报错: dat=fread( test.txt ) Error in fread( test.txt ): Fileisencoded in UTF-16,thisencodingisnot& ...
个人分类: R语言|8145 次阅读|没有评论
R语言中dcast 和 melt的使用
2019-7-23 22:16
1. 图片说明 2. 例子 示例数据: set.seed(123) dat = data.frame(ID = paste0(ID_,1:10),y1 = rnorm(10),y2=rnorm(10),y3=rnorm(10),y4 = rnorm(10)) dat 结果 dat ID y1 y2 &nb ...
个人分类: R语言|16551 次阅读|没有评论

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