物种分布模型相关的R程序包列表

热度 4 张金龙 2018-7-11 18:14

最新版本参见 https://github.com/helixcn/sdm_r_packages 前言 自从BIOMOD程序包在CRAN发布以来，众多的生态学家将注意力集中到R。 这是因为： 用R语言开发软件包相对容易，R中的数据对象类型容易学习和理解，数据读取等也非常容易。 近些年诞生的一些R程序包，让R十分方便地处理shape文件和ra ...

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Shiny程序包学习要点

热度 1 张金龙 2018-6-27 21:57

全文PDF Shiny.pdf 1. 什么是Shiny? 2. Shiny App的基本结构 2.1 运行Shiny App 2.2 app.R文件 2.2.1 ui用户界面 2.2.2 server函数 2.2.3 shinyApp &nb ...

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用R绘制采样点地图——带指北针、比例尺、图例

张金龙 2018-4-28 01:03

本例子中的代码已经不推荐使用，tmap版本的地图示例参见 http://blog.sciencenet.cn/blog-255662-1144743.html 如果所示： 用R绘制的采样点地图 ——带指北针、比例尺、图例等 更多请参考 https://news-at.zhihu.com/story/9275383 源代码和数据下载 用R绘制采样 ...

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大样地海拔数据的克里格插值与地形图绘制

张金龙 2018-4-24 20:11

最近收到几位同学求助， 咨询如何通过全站仪测得的海拔数据绘制大样地的地形图以及计算地形因子，本文作简要说明。本文中，“样方”是大样地中边长为20m的样方。前面的博文 （ http://blog.sciencenet.cn/blog-255662-1081363.html ）简要介绍了大样地中样方的命名方法以及物种调查数据的整理过程 ...

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用RSS追踪研究植物生态学研究进展简明教程

张金龙 2018-4-3 17:02

1.下载附件 plant_ecology rss.zip 解压缩，有两个文件 RSSOwl.2.2.1.Setup.exe 和 plant_ecology.opml文件 2. 双击安装 RSSOwl.2.2.1.Setup.exe 开始安装 RSS 浏览器， 选默认就好， 安装过程没什么好说的。因为 RSSOwl 是用 Java 写的， 因此如果没有安装 Java Runtime 的电脑 ...

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高水平论文讨论的写法 -- 从祝燕等(2018)的论文说起

张金龙 2018-2-21 08:56

大年三十这天，中国科学院植物研究所祝燕师姐的一篇关于热带地区树种密度制约的论文在Ecology Letters上线了。其实最有发言权的应当是作者本人 （ http://www.biodiv.ibcas.ac.cn/staff/zhuyan.html ），但是她一直忙于科研，而且极为低调和谦逊，很少抛头露面。因此，笔者在这里简要介绍一下她的这项研究，并谈谈读后感 ...

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