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chenye54007 2016-4-1 20:38
龚老师您好,请问一下,你加载的文件“chrome”里面的内容是怎么样的啊?我最近刚好要学习这个,麻烦老师了
luzeyuan 2014-9-24 13:40
龚老师您好,期待有机会到您那边访学!
chunxiage 2014-5-7 11:27
龚老师, 你好,我是刚开始学习SNP-calling的工作,参照您的方法使用GATK和SAMtools进行SNP-calling,遇到问题,我进行到第6.1,$ samtools mpileup -DSugf genome.fasta sample.realn.bam | \  bcftools view -Ncvg - > sample.samtools.raw1.vcf,我得的结果没有出现sample01.samtools.raw.vcf.dix这个文件。 接着做6.2时就出现了错误:##### ERROR MESSAGE: Your input file has a malformed header: Count < 0 for fixed size VCF header field PL。 您能帮忙看看是什么原因造成的,怎么解决吗? 非常感谢您百 ... ...
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