科学网—lephar的博文

从辉瑞新冠口服药聊聊新药研发

赵洪桃 2021-11-7 02:10

继默克的Molnupiravir，辉瑞近日也公布了其新冠口服新药PAXLOVID的II/III期临床中期试验结果。PAXLOVID可以降低89%的重症与死亡风险，远远好于吉利德的静脉注射药物Remdesivir，比默克公布的Mmolnupiravir数据也更好。PAXLOVID是抗病毒药物利托那韦（Ritonavir）和新冠病毒蛋白酶抑制剂PF-07321332的复方制剂，在感染早期 ...

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虚拟筛选之匠心独具

赵洪桃 2021-5-16 01:25

时光荏苒，距离上一篇高通量虚拟筛选基础篇已有六年。本文采用基于显水模型的对接方案，并根据蛋白—配体作用模式分析化合物的结合构象，以提高预测准确性。本文以EphB4激酶结构域为例，力图重现文献上通过高通量虚拟筛选发现的新型抑制剂。 1. 显水模型对接 ...

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大浪淘沙——新药研发中的AI

赵洪桃 2018-8-27 21:57

化学空间犹如浩瀚的宇宙，即使几十亿的DNA化合物库亦不过是沧海一粟。药物研发中的化合物优化其实是在衍生物空间搜寻局部最优解的过程。遗憾的是，即使衍生物空间对人类来说也还是太大，所以化合物优化依赖经验丰富的药物化学家来构思尽可能多的衍生物并依据经验或计算来寻找通往局部优解的捷径。之前基于预定义的化学反 ...

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科研论文花落谁家

热度 11 赵洪桃 2017-8-10 04:07

在科学交流日益国际化的今天，论文发表在英文期刊上，本无可厚非。但是，考虑到学术界特别是工业界很多同胞的英文程度，论文应该发表在中文还是国外英文期刊上——就很有必要讨论一下了。论文发表在国外英文期刊，除非是开源期刊，论文的知识产权包括中文译本是属于国外出版社的。即使我们有能力在文章发表的一个星期内将 ...

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大数据助力中药抗癌分子机制研究

热度 3 赵洪桃 2016-11-19 19:08

历经数百年或上千年的实际使用经验，部分中药的确有治疗益处。譬如，复方苦参注射液（ CKI ）在国内被批准用于治疗各种癌症肿瘤，通常作为西医化疗的一种辅助，但是它如何起作用，目前我们还不清楚。中药的分子机理研究受困于高度复杂的生物系统以及复杂的中药成分。中药的分子机制缺乏一方面不能将中药复方中的有害成 ...

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药物筛选之众里寻他千百度

热度 8 赵洪桃 2016-6-12 00:07

化学空间——碳、氢、氧、氮、硫等元素构成的化合物——有多大？咋听之下，这个问题似乎跟宇宙是否有界一样的无厘头。不过，却是药物研发不得不面对的一个基本“哲学”问题。来自塔夫茨中心的报告声称药物研发的平均成本高达 25 亿美元。从临床前到临床一期、二期、三期直至被批准，候选药物过五关斩六将的同时也损 ...

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药物设计：虚拟高通量筛选

热度 2 赵洪桃 2015-5-17 00:30

1. 前言药物设计中活性化合物的发现可谓是大海捞针，西方谚语云“ a needle on a haystack ”。神农氏尝百草的原始方法已然不能满足现代药物开发的需求。即使基于现代自动化技术，动辄数十万乃至上百万的化合物筛选依然耗资数百万美元，历时一年左右。计算机辅助药物设计——在分子层面上理解 ...

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春雷滚滚——基因疗法

热度 8 赵洪桃 2015-4-23 03:38

过去一年，医药界收获了太多的惊喜。默克抗PD-1免疫疗法新药Keytruda获美国FDA批准，标志着酝酿了数十年之久的癌症免疫疗法终于开始释放它的潜力。曾经被认为过度炒作的基因疗法也于近期扬眉吐气了一回。 Wiskott-Aldrich氏症候群是一种性联隐形遗传疾病。全世界每百万新生儿中大概有不到十人会患有这种先天性遗传疾 ...

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科学人之科学素养：也谈爱因斯坦给斯威泽的回信

热度 13 赵洪桃 2015-4-21 03:48

近日，科学网上就爱因斯坦给斯威泽回信的讨论，风生水起，甚是热闹。遗憾的是，焦点基本上全集中在对“those discoveries”的理解上，而对爱因斯坦信中提到的西方科学发展的两大基础视而不见。喧嚣热闹的背后，难免有一丝隐忧。古代中国是否有科学发现？四大发明、圆周率、勾股定理算不算？我们引以为傲的四大发明的确推 ...

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科学发展的基础

热度 2 赵洪桃 2015-4-16 02:54

前几日，科学网上有篇谈论爱因斯坦给斯威泽回信的博文，读来饶有兴趣。斯威泽同学就古代中国是否有科学的问题写信给爱因斯坦，老爱同志在回信中谈到，西方科学的发展是建立在两项重大成就基础之上的：古希腊先贤哲学家建立的形式逻辑体系，以及文艺复兴时期发现通过系统实验揭示因果关系的可能性。不禁联想到科学网 ...

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