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置顶 · 升级版|16srRNA微生物多样性测序报告解读
2021-4-1 17:29
微生物多样性测序(扩增子测序)是基于二代高通量测序对16S/18S/ITS等序列进行测序。可以同时检测样本中的优势物种、稀有物种及一些未知物种的检测,获得样本的微生物群落组成以及相对丰度。 相信关注我们的小伙伴对此并不陌生。 这次我们整合了大家平时会遇到的一些问题,在原有的基础上对报告进一步完善。 ...
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置顶 · [转载]多快好省的宏基因组研究技巧 — 资深专家分享
2020-4-27 13:34
谷禾健康 原创 近年的研究热点集中于环境和生物体相互作用的微生物群体,而大量复杂的微生物群体存在培养困难,构成复杂(包括细菌、古菌、真菌、原生生物、病毒甚至小型真核生物)。因此 如何用高通量精准的了解这些群体的构成,基因功能分布以及具体的表达活性和代谢状况 成为首要问题。 高通量测序技术 ...
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置顶 · [转载]微生物多样性测序结果如何看?
隐藏 2019-11-18 14:37
原文 如何读懂和利用你的微生物多样性测序结果? 谷禾健康 原创 做过16s测序的小伙伴们都知道 测完之后会拿到一份结果报告 但这并不代表可以开始写文章了 看似一大堆数据图表却不知如何下手 这是很多人头疼的地方 那么怎样给报告中的数据赋予灵魂 让它真正成为对你有帮助的分析呢? 今天我们来详细解 ...
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研究速递|微生物群衍生的肽模拟物可导致致命的炎性心肌病
牛耀芳 2019-11-20 10:46
近日, 国际顶级方法学期刊《 Science 》发表了一篇由瑞士免疫生物研究所的研究成成果: Microbiota-derived peptide mimics drive lethal inflammatory cardiomyopathy (微生物群衍生的肽模拟物可导致致命的炎性心肌病), 此项表明针对遗传易感性心肌炎患者或通过抗生素进行检查点抑制剂 ...
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[转载]可用于分析微生物与代谢产物之间相互作用的人工神经网络
牛耀芳 2019-11-19 13:09
谷禾健康 原创 最近, 国际顶级方法学期刊《Nature Methods》发表了由加利福尼亚大学圣地亚哥分校儿科、加州大学计算机科学与工程系 、加州大学合作质谱创新中心以及加利福尼亚大学圣地亚哥分校微生物群创新中心 多学科合作研究的最新成果:“Learning representations of microbe–metabolite Interactions(可用于分 ...
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