博文

看起来简单，做起来难

2014-11-10 17:55

最近在处理snp标记，需要对1万左右的snpmaker进行标记定位，本来打算用mapmaker，结果数量有限制，试用了一些其他软件，结果也不是很理想，闫双勇老师实验室的软件可以用，当标记距离很近时，标记顺序会出错。最后没办法，先把标记按染色体分，然后再用mapmaker3.0，结果运行起来花很多时间。有更好的解决方 ...

3080 次阅读|没有评论

提取指定位置的序列 extract fasta sequence by their position

热度 1 2014-11-9 17:12

我们要获得100个基因的启动子序列（ATG上游2k），我知道了这些基因atg的位置。 我习惯举例子来说明问题，小麦3B染色体序列我们已经有了，fasta格式 ，格式如下： 3B CAACCAGAAAATTCTTTGGTAGGCATGAAGGTCTCTGTCACTTGTTCGCCGTTGCTTCAA ATAATAAAGATCAATTATGCTGATTTTGTTGGGCCTAATACAAACTTGATTTAC ...

9427 次阅读|1 个评论 热度 1

开篇

热度 2 2014-11-9 16:49

终于在高大上的科学网上注册了一个用户，以前一直来看前辈的博客，很多朋友经常更新，在下很佩服，说这话是因为这种事情我做不来，今天更新，下次就不知道哪年了。后来想想，从别人那里讨教了很多知识，应该分享下自己的学习体会。闲话不多说，首先要做个自我介绍，给大家留个印象。 &nb ...

2924 次阅读|3 个评论 热度 2

本页有 1 篇博文因作者的隐私设置或未通过审核而隐藏