衣带渐宽终不悔分享 http://blog.sciencenet.cn/u/tuqiang2014 在康河的柔波里,做一条水草, 向青草更青处漫溯。

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分享 统计推断概述
2019-1-12 11:05
什么是统计推断 对于要做统计推断的人来讲,这个问题似乎显得多余,他们往往关心 怎样做统计推断 。这也许可以窥得发展中国家在经济增长中的一个弊端:知其然,不知其所以然。因为别人已经做出来了嘛,我管那么多干嘛,先做出来再讲!然而,核心科技我们还是要掌握的。 我们经常讲概率统计,概率统计,这并不是一个词 ...
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分享 环境与生态统计||假设检验
2019-1-12 11:02
假设检验也叫显著性检验,是以小概率反证法的逻辑推理,判断假设是否成立的统计方法,它首先假设样本对应的总体参数(或分布)与某个已知总体参数(或分布)相同,然后根据统计量的分布规律来分析样本数据,利用样本信息判断是否支持这种假设,并对检验假设做出取舍抉择,做出的结论是概率性的,不是绝对的肯定或否定。 ...
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分享 环境与生态统计||统计建模概述
2019-1-12 11:00
什么是统计建模 统计建模是以计算机统计分析软件为工具,利用各种统计分析方法对批量数据建立统计模型和探索处理的过程,用于揭示数据背后的因素,诠释社会经济以及自然现象,或对经济社会以及自然发展作出 预测或判断 。预测和判断是我们做数据分析的首要任务,这里所讲的模型,是指对于某个实际问题或客观事物、规律 ...
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分享 ggplot2:方差分析多重比较标注显著字母
2018-12-16 11:51
赖江山老师在科学网分享了Francois Gillet编写的两个方差分析多重比较的函数 boxplert()和boxplerk()【来源Numerical Ecology with R (second Edition)】 我看了一下出图的部分是用boxplot函数绘制的,作为一个ggplot2的爱好者自己尝试着用ggplot2把函数boxplert()重新写了一下。在重写的过程中收获几个问题: X 轴如何 ...
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分享 R语言实现桑基图绘制
2018-12-10 15:32
什么是桑基图 桑基图(Sankey diagram),即桑基能量分流图,也叫桑基能量平衡图。它是一种特定类型的流程图,图中延伸的分支的宽度对应数据 流量 的大小,比较适用于用户流量等数据的可视化分析。因1898年Matthew Henry Phineas Riall Sankey绘制的“蒸汽机的能源效率图”而闻名,此后便以其名字命名为“桑基图”。 用 ...
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分享 ggtree绘制进化树
2018-12-4 14:12
setwd(C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\tree) library(ggtree) library(ggplot2) tree - read.tree(species.tree) ggtree(tree,layout = circular) ggtree(tree, layout=fan, ladderize = FALSE, branch.length = none)+ geom_tiplab2(si ...
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分享 三元相图理解以及R实现
2018-12-4 14:09
什么是三元相图 三元图是重心图的一种,它有三个变量,但需要三者总和为恒定值。在一个等边三角形坐标系中, 图中某一点的位置代表三个变量间的比例关系 。在群体遗传学中,它被称做Finetti图;在博弈论中,常被称为simplex图。 在高通量测序分析领域中,最常用的是两组间的比较,展示的方式有火山图、曼哈顿图等, ...
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分享 NGS通识第零讲||NGS通识
2018-11-24 09:25
一些历史学家发现,当现有的知识或新兴技术积累到充裕的程度时,会有很多不同的研究者同时专研一个科学问题并同时产生新的发现。 开始在简书以通识课的形式讲下一代测序(next-generation sequencing,NGS)的知识了。在有的框架里面NGS专指二代测序,但是在我们这个框架里,主要指二代测序,但是一代二三代的都会有涉及 ...
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分享 环境与生态统计笔记||绪论
热度 1 2018-10-21 22:48
在上一本《数量生态学:R语言应用》将要结束的时候,我就开始物色下一本可以按章节更新笔记的书籍。这时排在我面前的是三本书:《机器学习实战》,《环境与生态统计:R语言应用》、《网络数据的统计分析:R语言实践 》。《机器学习实战》是早就想写的了,毕竟那么高大上的东西,是不想早点靠近呢,何况还是python那么美的 ...
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分享 数量生态学笔记||典范排序概述
热度 1 2018-8-29 22:07
起了个大早做这张导图,不知道会不会吓到大家。有一周没有更新我们的《数量生态学笔记》了,因为这一章还是蛮有难度的,书中就是说这一章我们来讲典范排序,然后就直接讲RDA了。看RDA一会排序一会回归,书中的每一个汉字都认识,放在一起的一个句子就不懂了。这基本上就是我的一个状态,所以就没更新。 本来以为只要多 ...
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GMT+8, 2020-2-21 03:14

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