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相关分析与回归分析
2018-7-8 22:00
变量:自变量和因变量;变量之间的联系或依存类型:函数关系和相关关系 相关关系 :变量数值之间存在非严格的依存关系。一个变量或几个变量取定一个数值时,另一个对应的数值不确定。相关关系存在因果关系,相互依存关系(难判断因果),虚假统计关系。 函数关系 :函数形式存在一一对应关系。一个变量取定一个 ...
个人分类: 统计|2254 次阅读|1 个评论
文献管理
2018-7-7 18:03
最近写文章的时候,总结了一个省时省力管理文献的方法,使用mendeley结合zotero,文献存储的思想在重搜索,轻整理。 zotero结合网络插件,添加目标文献到桌面管理器中,并在后台自动下载。zotero对下载的文献自动命名 mendeley在文章写作和文献阅读时使用,文献引用精准便捷。 listary搜索文献,及zotero中根据标签 ...
个人分类: 文献管理|2031 次阅读|没有评论
PCA分析内涵----学习笔记
2018-6-29 17:37
https://mp.weixin.qq.com/s/sRElBMkyR9rGa4TQp9KjNQ 主成分分析的意义 简化运算。 在问题研究中,为了全面系统地分析问题,我们通常会收集众多的影响因素也就是众多的变量。这样会使得研究更丰富,通常也会带来较多的冗余数据和复杂的计算量。 比如我们我们测序了100种样品的基因表达谱借以通过分子 ...
个人分类: 统计|2621 次阅读|没有评论
PERMANOVA分析
2018-6-28 21:04
Permanova分析及adonis分析,单做PCoA分析不够,需要互相配合证明组间差异确实显著 phyloseq上一些demo不错,可以作为学习的材料。 http://deneflab.github.io/MicrobeMiseq/demos/mothur_2_phyloseq.html
个人分类: R|18968 次阅读|没有评论
《生物信息学》
2018-6-15 15:04
今天搜索公众号的时候,看到一个浙大农学院办的“生信大讲堂”,里面有一些生信方面相关的讲座,隔壁学院我都才知道。内容很丰富,我也很需要相关知识,以后去听下他们的讲座 推文中有一本樊龙江教授的书籍《生物信息学》,还有他们lab的主页 http://ibi.zju.edu.cn/bioinplant/ 。 书籍内丰富,系统性很强,决定 ...
个人分类: 统计|2560 次阅读|没有评论
数据不满足方差齐性和正态分布时应该如何处理?
2018-6-15 10:57
找到一个生物方面的数据转化处理指南,摘了一些笔记,原文网址如下: http://www.biostathandbook.com/transformation.html If a measurement variable does not fit a normal distribution or has greatly different standard deviations in different groups, you should try a data transformation. ...
个人分类: 统计|10719 次阅读|4 个评论
书籍阅读:1947年黄昆给杨振宁的一封信
热度 1 2018-6-5 17:57
1947年4月黄昆给我的一封信* 杨振宁 黄昆和我在西南联大研究院是同班同学。我们于1944年得到物理学硕士学位。一年以后 ,我们先后出国,去修读博士学位。他去了英国,我去了美国。出国以后我们不常通信 ,可是每次提笔写信却总是写得很长。1947年2月或3月我给他写了一封长信。那 ...
个人分类: 人文|3324 次阅读|没有评论 热度 1

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