AureoWiki---金黄色葡萄球菌研究和注释数据库

熊朝亮 2022-1-11 09:59

AureoWiki https://aureowiki.med.uni-greifswald.de/Main_Page AureoWiki 可以搜索五种金黄色葡萄球菌COL、N315、NCTC8325、Newman 和 USA300_FPR3757 的基因座标签、基因或蛋白质名称。五种金黄色葡萄球菌菌株的直系同源基因并排显示，使用顶部的注册标签可以轻松地在它们之间切换。直系同源基因通过所谓的统一“Pan ...

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GDSC---肿瘤药物敏感性基因组学数据库

熊朝亮 2021-11-22 21:16

GDSC (Genomics of Drug Sensitivity in Cancer): https://www.cancerrxgene.org/ GDSC提供免费公开的肿瘤治疗基因组数据，致力于发现潜在的肿瘤治疗靶点以改善肿瘤治疗，是全球最大的同类型公共数据库。 GDSC数据库支持 化合物(药物) 、 细胞系 和 癌基因 三种检索方式。化合物的相关信息由行业、学术合作伙伴或 ...

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抗生素耐药数据库

熊朝亮 2021-11-17 23:18

1. CARD (The Comprehensive Antibiotic Resistance Database): https://card.mcmaster.ca/home https://card.mcmaster.ca/browse 2. MEGARes : http://megares.meglab.org/

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细菌生物膜靶向肽数据库

熊朝亮 2021-11-15 23:58

BaAMPs (Biofilm-active AMPs database): http://www.baamps.it/ 2. dPABBs (Design Peptides Against Bacterial Biofilms): https://ab-openlab.csir.res.in/abp/antibiofilm/

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VFDB---细菌毒力因子数据库

熊朝亮 2021-11-15 23:43

VFDB数据库网址： http://www.mgc.ac.cn/VFs/ 该数据库目前已涵盖74个属，两千余个致病因子，三万多条基因序列。是目前公开的、细菌致病因子最大的数据库。 VFDB数据库支持四种搜索方式 （1）菌株名搜索 （2）关键词搜索 （3）序列比对搜索 （4）热词搜索/关键词列表搜索 对于搜索得到的毒力 ...

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SwissTargetPrediction---小分子药物靶点预测在线平台

熊朝亮 2021-11-15 00:40

SwissTargetPrediction官方网址： http://swisstargetprediction.ch/ SwissTargetPrediction基于与已知化合物的二维和三维结构的相似性来预测化合物的靶标。预测可以在人、大鼠、小鼠三种不同物种中进行。已知的化合物-靶标相互作用来自第16版的ChEMBL数据库，它由280381个小分子与2686个靶标间的相互作用构成，其中大多 ...

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