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生物信息绘图之python绘图
热度 2 2016-6-10 16:10
生物信息的绘图在我认为是十分重要的。我读到的几乎每一篇好文章,都有一两幅图具有代表性的简洁——精炼、易懂。而且,绘图也是数据分析中不可缺少的环节。说这么多,就是说绘图很重要啦! 绘图的软件特别多,尤其是以R语言出名,数据统计分析与图形紧密结合起来,是一个非常棒的工具。推荐 ...
个人分类: 生物信息绘图|10064 次阅读|6 个评论 热度 2
Interproscan的安装与使用
热度 2 2016-6-5 16:15
  Interproscan是什么?能做什么?怎么做?   对于前两个问题,给你这个页面,可能会给你一些帮助。 http://www.ebi.ac.uk/interpro/about.html 至于怎么做,从我安装失败几次的经验中,我可以给一些建议。   首先,就是安装软件需要的配置问题。即安装环境 https://github ...
个人分类: linux|12659 次阅读|3 个评论 热度 2
生物信息——kegg分析的kobas软件的安装与使用
热度 1 2016-3-10 21:18
关于kegg的ko和K的分析,本以为可以通过interproscan来获取,谁知跑出来的结果只涉及新陈代谢,不能使用。最终还是使用北大开发的kobas做的kegg分析。 关于kobas的简介,这里有网址 http://kobas.cbi.pku.edu.cn/help.do ,这个网址支持在线分析,不过对于gene数目大于500的 ...
个人分类: linux|24910 次阅读|2 个评论 热度 1
生物信息——windows下的perl环境的配置
2015-11-2 20:23
大部分的生物信息学的生信工作者使用perl语言作为数据分析语言。对于非计算机出身的人而言,配置一个好的perl环境也有一定难度。 从新更换了一台电脑,就把如何在windows下配置perl及bioperl做了记录。 首先从perl的官网 https://www.perl.org/ 下下载最新版本的acti ...
个人分类: perl|6438 次阅读|没有评论

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