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- 置顶 · 学习生物信息的第二好教程
- 生信的作用越来越大，想学的人越来越多，不管是为了以后发展，还是为了解决眼下的问题。但生信学习不是一朝一夕就可以完成的事情，也许你可以很短时间学会一个交互式软件的操作，却不能看完程序教学视频后就直接写程序。也许你可以跟着一个测序分析流程完成操作，但不懂得背后的原理，不知道什么参数需要修改，结果可以出 ...
- 这个为生信学习打造的开源Linux教程真香！！！
- 生物信息学习的正确姿势 NGS系列文章包括 NGS基础 、 在线绘图 、转录组分析（ Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这 ）、ChIP-seq分析（ ChIP-seq基本分析流程 ）、单细胞测序分析( 重磅综述：三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程 )、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘（ 典 ...
- 别人的电子书，你的电子书，都在bookdown
- bookdown 是著名R包作者谢益辉开发的，支持采用 Rmarkdown (R代码可以运行)或普通 markdown 编写文档，然后编译成 HTML , WORD , PDF , Epub 等格式。样式清新，使用简单，值得拥有。(点击 阅读原文 ，跳转博客，所有外链可点) 在Bookdown的官网，有很多免费的用 bookdown 写的R书籍，如Hadley Wickham等撰写的《R ...
- 一文掌握Conda软件安装：虚拟环境、软件通道、加速solving、跨服务器迁移
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- 你和PPT高手之间，就只差一个iSlide，新版本支持WPS、Office
- 你和PPT高手之间，就只差一个iSlide 文中介绍了islide的几个功能和示例应用，很受欢迎。后来有朋友留言，新版的islide支持WPS，故更新个提示。具体功能使用见下图，获取方式为访问网址 https://www.islide.cc （为方便点击，可后台回复 PPT 或 islide 获取超链接）。 另外还有 推荐 3 个超赞 ...
- 这篇文献总结了常见的中式英语写法，来看看有没有中枪？
- The Most Common Habits from more than 200 English Papers written by Graduate Chinese Engineering Students By Felicia Brittman 这篇文章通过示例，一对一的指出原文写法错误是什么，应该怎么写，为什么会出现这个错误，并给出一些修改建议。可以作为自己写作前指导或写作后检查指导。并且有斯坦福视频写 ...
- 总被审稿人提起的多重假设检验校正是什么？
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- 基因表达聚类分析之初探SOM - 自组织特征图
- 之前的 培训 有老师提出要做SOM分析，最后卡在 code plot 只能出 segment plot 却出不来 line plot 。查了下，没看到解决方案。今天看了下源码，设置了一个参数，得到 趋势图 。也顺便学习了SOM分析的整个过程，整理下来，以备以后用到。 更多聚类相关见： 基因共表达聚类分析和可视化 聚类分析factoextra 获取ph ...
- 生信分析过程中这些常见文件的格式以及查看方式你都知道吗？
- 生信分析过程中，会与很多不同格式的文件打交道，除了原始测序数据 fastq 之外，还需要准备基因组文件 fasta 格式和基因注释文件 gtf 格式。在分析的过程中还会有众多中间文件的生成，如 bed 、 bed12 、 sam 、 bam 、 wig 、 bigwig 、 bedgraph 等，生成后我们一般会查看下内容了解文件每一列的含义，以此来决定需要提 ...
- 哈佛大学单细胞课程|笔记汇总 （二）
- 生物信息学习的正确姿势 NGS系列文章包括 NGS基础 、转录组分析（ Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这 ）、ChIP-seq分析（ ChIP-seq基本分析流程 ）、单细胞测序分析( 重磅综述：三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程 （原理、代码和评述） )、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据 ...
- 哈佛大学单细胞课程|笔记汇总 （一）
- 生物信息学习的正确姿势 NGS系列文章包括 NGS基础 、转录组分析（ Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这 ）、ChIP-seq分析（ ChIP-seq基本分析流程 ）、单细胞测序分析( 重磅综述：三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程 （原理、代码和评述） )、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据 ...
