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  • 南京农大,农学院,博士在读

    • 生命科学->遗传学与生物信息学->生物信息学

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转录因子富集分析 2018-11-13
转录因子富集分析 转录因子因子富集分析背后的原理与GO,KEGG等富集分析是一样的。 这里还是使用Y叔的R包“clusterProfiler”。 首先我们要知道哪些 ...
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普通小麦染色体着丝粒位置 2018-10-22
普通小麦染色体着丝粒位置 记得前面有小伙伴问我如何确定着丝粒的位置。今天我就把位置给大家,见下图。 该表来自今年science文章,应该是比较权 ...
(333)次阅读|(0)个评论
使用salmon和sleuth进行小麦RNA-seq差异表达分析 2018-09-27
  blast大家一定熟悉吧, 最近有大神爆出一个bug。也即参数“-max_target_seqs”并不是你理解的那样。下图红色箭头处是NCBI上的设置选项。根据NCBI的官方文 ...
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[转载]中国春不同版本基因ID的查询与转换 2018-09-13
  最近有不少小伙伴询问不同版本基因ID之间转换的问题,希望可以有个对应表之类的,这样搜索基因名字就可以查询。如果有一定的生信基础,一个mapping工 ...
(344)次阅读|(0)个评论
使用salmon和kallisto进行RNA-seq定量 2018-09-07
  salmon软件于2017年发表在Nature Methods,论文题目是“ Salmon provides fast and bias-aware quantification of transcript expression ” 。不到两 ...
(638)次阅读|(0)个评论
[转载]2018年小麦国自然统计 2018-08-18
  本文根据关键词“小麦”查询而来,如有遗漏实属正常,本结果仅供参考,勿用作其他正式场合。恭喜上榜的各位老师。 目前仅包括面上项目、青年项目 ...
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大麦铝耐受性基因HvAACT1研究 2018-08-12
牙疼不是病,疼起来要人命。借此,呼吁大家,一定爱护牙齿,定期做检查。 今天要介绍的这篇文章发表在Plant Physiology上,题目是“ Retrotransposo ...
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小麦单基因分析 2018-08-06
  前面我们谈了如何调取目标区间的序列、基因等。今天我们再详细说一说如何利用手头上的数据进行基于单基因的分析。 今天的主角是GW5,我们前面在《 ...
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