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    • 生命科学->遗传学与生物信息学->生物信息学

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小麦有关的会议摘要——第十九届国际动植物基因组学大会 2019-01-11
小麦有关的会议摘要——第十九届国际动植物基因组学大会 摘要网址  https://plan.core-apps.com/pag_2019/.   打开下面这个网址( https://pla ...
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[转载]中国春甲基化数据 2018-11-27
中国春甲基化数据 表观遗传学中,甲基化的研究是重要的一块研究内容。最近小麦品种中国春的参考基因组在science杂志上发表。文章中有甲基化的数据,为了让 ...
(558)次阅读|(0)个评论
转录因子富集分析 2018-11-13
转录因子富集分析 转录因子因子富集分析背后的原理与GO,KEGG等富集分析是一样的。 这里还是使用Y叔的R包“clusterProfiler”。 首先我们要知道哪些 ...
(683)次阅读|(0)个评论
普通小麦染色体着丝粒位置 2018-10-22
普通小麦染色体着丝粒位置 记得前面有小伙伴问我如何确定着丝粒的位置。今天我就把位置给大家,见下图。 该表来自今年science文章,应该是比较权 ...
(546)次阅读|(0)个评论
使用salmon和sleuth进行小麦RNA-seq差异表达分析 2018-09-27
  blast大家一定熟悉吧, 最近有大神爆出一个bug。也即参数“-max_target_seqs”并不是你理解的那样。下图红色箭头处是NCBI上的设置选项。根据NCBI的官方文 ...
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[转载]中国春不同版本基因ID的查询与转换 2018-09-13
  最近有不少小伙伴询问不同版本基因ID之间转换的问题,希望可以有个对应表之类的,这样搜索基因名字就可以查询。如果有一定的生信基础,一个mapping工 ...
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使用salmon和kallisto进行RNA-seq定量 2018-09-07
  salmon软件于2017年发表在Nature Methods,论文题目是“ Salmon provides fast and bias-aware quantification of transcript expression ” 。不到两 ...
(1161)次阅读|(0)个评论
[转载]2018年小麦国自然统计 2018-08-18
  本文根据关键词“小麦”查询而来,如有遗漏实属正常,本结果仅供参考,勿用作其他正式场合。恭喜上榜的各位老师。 目前仅包括面上项目、青年项目 ...
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