GATK流程不用再分割小麦染色体 part2 2021-06-11

鉴于上次发表的" GATK流程不用再分割小麦染色体 "，有些内容说的不是很清楚, 且科学网博客发表之后无法更改，遂再次更新一次。 对小麦来说，染色体较大 ...

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NCBI上传fastq.gz以及bam文件有文件大小限制 2021-06-10

NCBI上传fastq.gz以及bam文件有文件大小限制。 fastq.gz不能超过200G，bam不能超过500G。

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bwa samtools 衔接时的一些注意事项 2021-06-09

每台服务器都有自己的脾气，硬件上CPU和内存不同，软件上系统环境不一样。 长时间使用一台服务器或电脑，写好的很多流程，软件参数几乎都是固定的，而且都 ...

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基因注释小结 2021-03-05

基因注释一般是指采用生物信息学的方法获得已组装好的基因组中基因的位置、结构等信息，一般包括从头注释、同源注释和基于转录组和蛋白质组的注释。基于转录组 ...

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浅谈转基因生物的安全性 2021-01-17

浅谈转基因生物的安全性 贾海燕 马省伟 转基因生物安全性问题一直是当今社会大众谈论的热点。随着人类生活条件越来越好，人们对食品的安全性要求也不 ...

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GATK流程不用再分割小麦染色体 2020-09-20

小麦GATK流程不支持小麦整条染色体，主要是指不支持bam文件和vcf文件的index。所以把index问题解决了，问题是不是就解决了呢？ GATK有些步骤会自动index，需 ...

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综述|植物泛组学:方法、应用与进展 2020-03-23

随着越来越多的植物基因组的组装，人们发现一个单一的参考组装并不能反映一个物种的基因多样性。泛基因组 反映了基因组中的结构变异和多态性，从而能够深入比 ...

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